0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 2 2a 2b 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 30a 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 92 93 94 95 96 97 98 99 100 101 102 103 104 105 106 107 108 109 110 111 112 113 114 115 116 117 118 119 120 121 122 123 124 125 126 127 128 129 130 131 132 133 134 135 136 137 138 139 140 141 142 143 144 145 146 147 148 149 150 151 152 153 154 155 156 157 158 159 160 161 162 163 164 165 166 167 168 169 170 171 172 173 174 175 176 177 178 179 180 181 182 183 184 185 186 187 188 189 190 191 192 193 194 195 196 197 198 199 200 201 202 203 204 205 206 207 208 209 210 211 212 213 214 215 216 217 218 219 220 221 222 223 224 225 226 227 228 229 230 231 231a 231b 232 233 234 235 236 237 238 239 240 241 242 243 244 245 246 247 248 249 250 251 252 253 254 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 96 97 97a 98 99 100 101 102 103 104 105 106 107 108 109 110 111 112 113 114 115 116 117 118 119 120 121 122 123 124 125 126 127 128 129 130 131 132 133 134 135 136 137 138 139 140 141 142 143 144 145 146 147 148 149 150 151 152 153 154 155 156 157 158 159 160 161 162 163 164 165 166 167 168 169 170 171 172 173 174 175 176 177 178 179 180 181 182 183 184 185 186 187 188 189 190 191 192 193 194 195 196 197 198 199 200 201 202 203 204 205 206 207 208 209 210 211 212 213 214 215 216 217 218 219 220 221 222 223 224 225 226 227 228 229 230 231 232 233 234 234a 234b 234 235 236 237 238 239 240 241 242 243 244 245 246 247 248 249 250 251 252 253 254 255 256 70 pronghorn Antilocapra americana F090852 - wt main pro >100_Ant.ame.lon.fer.rum.bov:: - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - C K K R P K P G G G W N T G G S R Y P G Q G S P G G N R Y P G G - T H S Q W N K P S K P K T N M K H V A G A A A A G A V V G G L G G Y M L G S A M S R P L I H F G N D Y E D R Y Y R E N M Y R Y P N Q V Y Y R P V D Q Y S N Q N T F V H D C V N I T V K Q H T V T T T T K G E N F T E T D I K M M E R V V E Q M C I T Q Y Q R E S Q - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 104 wisent Bison bonasus unpub.Sch01 long subset of S55629 wt main pro >110_Bis.bon.lon.fer.rum.bov:: - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - Q G S P G G N R Y P G G - T H G Q W N K P S K P K T N M K H V A G A A A A G A V V G G L G G Y M L G S A M S R P L I H F G S D Y E D R Y Y R E N M H R Y P N Q V Y Y R P V D Q Y S N Q N N F V H D C V N I T V K E H T V T T T T K G E N F T E T D I K M M E R V V E Q M C I T Q Y Q R E S Q A Y Y Q R G A S - - V - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 72 banteng Bos javanicus unpub.Sch13 short wt main pro >115_Bos.jav.sho.fer.rum.bov:: - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - P K P G G G W N T G G S R Y P G Q G S P G G N R Y P G G - T H G Q W N K P S K P K T N M K H V A G A A A A G A V V G G L G G Y M L G S A M S R P L I H F G S D Y E D R Y Y R E N M H R Y P N Q V Y Y R P V D Q Y S N Q N S F V H D C V N I T V K E H T V T T T T K G E N F T E T D I K M M E R V V E Q M C I T Q Y Q R E S Q A Y Y Q R G A S - - V I L F S S P P - - - - - - - - - - - - - - - 91 watussi Bos primigenius taurus unpub.Sch03 long 6 repeats wt main pro >120_Bos.pri.lon.fer.rum.bov:: - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - G Q G I P G G N R Y P G G - T H G Q W N K P S K P K T N M K H V A G A A A A G A V V G G L G G Y M L G S A M S R P L I H F G N D Y E D R Y Y R E N M H R Y P N Q V Y Y R P V D Q Y S N Q N N F V H D C V N I T V K E H T V T T T T K G E N F T E T D I K M M E R V V E Q M C I T Q Y Q R E S Q A Y Y Q R G A S - - V I L F S S P P V I L - - - - - - - - - - - - 54 cow Bos taurus D10614 short D90547 771bp wt main pro >125_Bos.tau.sho.fer.rum.bov:: M V K S H I G S W I L V L F V A M W S D V G L C K K R P K P G G G W N T G G S R Y P G Q G S P G G N R Y P G G - S H S Q W N K P S K P K T N M K H V A G A A A A G A V V G G L G G Y M L G S A M S R P L I H F G N D Y E D R Y Y R E N M H R Y P N Q V Y Y R P V D Q Y S N Q N N F V H D C V N I T V K E H T V T T T T K G E N F T E T D I K M M E R V V E Q M C I T Q Y Q R E S Q A Y Y Q R G A S - - V I L F S S P P V I L L I S F L I F L I V G - 55 cow Bos taurus S55629 long 6 repeats all:long main pro >130_Bos.tau.lon.fer.rum.bov:: M V K S H I G S W I L V L F V A M W S D V G L C K K R P K P G G G W N T G G S R Y P G Q G S P G G N R Y P G G - T H G Q W N K P S K P K T N M K H V A G A A A A G A V V G G L G G Y M L G S A M S R P L I H F G S D Y E D R Y Y R E N M H R Y P N Q V Y Y R P V D Q Y S N Q N N F V H D C V N I T V K E H T V T T T T K G E N F T E T D I K M M E R V V E Q M C I T Q Y Q R E S Q A Y Y Q R G A S - - V I L F S S P P V I L L I S F L I F L I V G - 58 cow Bos taurus AB001468 long 6 repeats all:long main pro >145_Bos.tau.lon.fer.rum.bov:: M V K S H I G S W I L V L F V A M W S D V G L C K K R P K P G G G W N T G G S R Y P G Q G S P G G N R Y P G G - T H G Q W N K P S K P K T N M K H V A G A A A A G A V V G G L G G Y M L G S A M S R P L I H F G S D Y E D R Y Y R E N M H R Y P N Q V Y Y R P V D Q Y S N Q N N F V H D C V N I T V K E H T V T T T T K G E N F T E T D I K M M K R V V E Q M C I T Q Y Q R E S Q A Y Y Q R G A S - - V I L F S S P P V I L L I S F L I F L I V G - 119 cow Bos taurus AJ132392 long 7 repeats all:long 7 main pro >147_Bos.tau.lon.fer.rum.bov:: - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - G G W N T G G S R Y P G Q G S P G G N R Y P G - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 87 nyala Tragelaphus angasi unpub.Sch24 - wt main pro >155_Tra.ang.....fer.rum.bov:: - - - - - - - - - - - - - - - - M W S D V G L C K K R P K P G G G W N T G G S R Y P G Q G S P G G N R Y P G G - T H G Q W N K P S K P K T N M K H V A G A A A A G A V V G G L G G Y M L G S A M S R P L T H F G N D Y E D H Y Y R E N M Y R Y P N Q V Y Y R P V D Q Y S N Q N N F V H D C V N I T V K Q H T V T T T T K G E N F T E T D I K M M E R V V E Q M C I T Q Y R R E S Q A Y Y Q R G A S - - V I L F S S P P V - - - - - - - - - - - - - - 60 greater kudu Tragelaphus strepsiceros X74759 C extra P40243 X74759 X74771 bad Martin has initial proline in A rep1 all:long main pro >160_Tra.str.lon.fer.rum.bov:: M V K S H I G S W I L V L F V A M W S D V A L C K K R P K P G G G W N T G G S R Y P G Q G S P G G N R Y P G G - T H G Q W N K P S K P K T N M K H V A G A A A A G A V V G G L G G Y M L G S A M S R P L I H F G S D Y E D R Y Y R E N M Y R Y P N Q V Y Y R P V D Q Y S N Q N N F V H D C V N I T V K Q H T V T T T T K G E N F T E T D I K M M E R V V E Q M C I T Q Y Q R E S E A Y Y Q R G A S - - V I L F S S P P V I L L I S F L I F L I V G - 111 greater kudu Tragelaphus strepsiceros unsub.Poi B Poidinger M Arch Virol 131: 193-199 (1993) wt main pro >161_Tra.str.sho.fer.rum.bov:: M V K S H I G S W I L V L F V A M W S D V G L C K K R P K P G G G W N T G G S R Y P G Q G S P G G N R Y P G G - T H S Q W N K P S K P K T N M K H V A G A A A A G A V V G G L G G Y M L G S A M S R P L I H F G N D Y E D R Y Y R E N M Y R Y P N Q V Y Y R P V D Q Y S N Q N N F V H D C V N I T V K Q H T V T T T T K G E N F T E T D I K I M E R V V E Q M C I T Q Y Q R E S Q A Y Y Q R G A S - - V I L F S S P P V I L L I S F L I F L I V G - 50 african goat Capris hircus S82626 - wt main pro >167_Cap.hir.....fer.rum.ovi:: M V K S H I G S W I L V L F V A M W S D V G L C K K R P K P G G G W N T G G S R Y P G Q G S P G G N R Y P G G - S H S Q W N K P S K P K T N M K H V A G A A A A G A V V G G L G G Y M L G S A M S R P L I H F G N D Y E D R Y Y R E N M Y R Y P N Q V Y Y R P V D Q Y S N Q N N F V H D C V N I T V K Q H T V T T T T K G E N F T E T D I K I M E R V V E Q M C I T Q Y Q R E S Q A Y Y Q R G A S - - V I L F S P P P V I L L I S F L I F L I V G - 53 goat Capris hircus unpub.Sch11 - all:212 RQ main pro >180_Cap.hir.....fer.rum.ovi:: M V K S H I G S W I L V L F V A M W S D V G L C K K R P K P G G G W N T G G S R Y P G Q G S P G G N R Y P G G - S H S Q W N K P S K P K T N M K H V A G A A A A G A V V G G L G G Y M L G S A M S R P L I H F G N D Y E D R Y Y R E N M Y R Y P N Q V Y Y R P V D Q Y S N Q N N F V H D C V N I T V K Q H T V T T T T K G E N F T E T D I K I M E Q V V E Q M C I T Q Y Q R E S Q A Y Y Q R G A S - - V I L F S S P P V I L L I S F L I F L I V G - 105 nubian ibex Capra ibex nubiana unpub.Sch02 - wt main pro >185_Cap.ibe.....fer.rum.ovi:: - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - K P G G G W N T G G S R Y P G Q G S P G G N R Y P G G - S H S Q W N K P S K P K T N M K H V A G A A A A G A V V G G L G G Y M L G S A M S R P L I H F G N D Y E D R Y Y R E N M Y R Y P N Q V Y Y R P V D Q Y S N Q N N F V H D C V N I T V K Q H T V T T T T K G E N F T E T D I K I M E R V V E Q M C I T Q Y Q R E S Q A Y Y - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 108 muskox Ovibos moschatus moschatus unpub.Sch06 - wt main pro >190_Ovi.mos.....fer.rum.ovi:: M V K S H I G S W I L V L F V A M W S D V G L C K K R P K P G G G W N T G G S R Y P G Q G S P G G N R Y P G G - S H S Q W N K P S K P K T N M K H V A G A A A A G A V V G G L G G Y M L G S A M S R P L I H F G N D Y E D R Y Y R E N M Y R Y P N Q V Y Y R P V D Q Y S N Q N N F V H D C V N I T V K Q H T V T T T T K G E N F T E T D I K I M E R V V E Q M C I T Q Y Q R E S Q A Y Y Q R G A S - - V I L F S S P P V I L L I S F L I F L I V G - 43 sheep Ovis aries AJ000738 VQ all:136 AV main pro >195_Ovi.ari.....fer.rum.ovi:: M V K S H I G S W I L V L F V A M W S D V G L C K K R P K P G G G W N T G G S R Y P G Q G S P G G N R Y P G G - S H S Q W N K P S K P K T N M K H V A G A A A A G A V V G G L G G Y M L G S V M S R P L I H F G N D Y E D R Y Y R E N M Y R Y P N Q V Y Y R P V D Q Y S N Q N N F V H D C V N I T V K Q H T V T T T T K G E N F T E T D I K I M E R V V E Q M C I T Q Y Q R E S Q A Y Y Q R G A S - - V I L F S S P P V I L L I S F L I F L I V G - 45 sheep Ovis aries AJ000736 AR all:171 QR main pro >200_Ovi.ari.....fer.rum.ovi:: M V K S H I G S W I L V L F V A M W S D V G L C K K R P K P G G G W N T G G S R Y P G Q G S P G G N R Y P G G - S H S Q W N K P S K P K T N M K H V A G A A A A G A V V G G L G G Y M L G S A M S R P L I H F G N D Y E D R Y Y R E N M Y R Y P N Q V Y Y R P V D R Y S N Q N N F V H D C V N I T V K Q H T V T T T T K G E N F T E T D I K I M E R V V E Q M C I T Q Y Q R E S Q A Y Y Q R G A S - - V I L F S S P P V I L L I S F L I F L I V G - 46 sheep Ovis aries AJ000734 AH all:171 QH main pro >205_Ovi.ari.....fer.rum.ovi:: M V K S H I G S W I L V L F V A M W S D V G L C K K R P K P G G G W N T G G S R Y P G Q G S P G G N R Y P G G - S H S Q W N K P S K P K T N M K H V A G A A A A G A V V G G L G G Y M L G S A M S R P L I H F G N D Y E D R Y Y R E N M Y R Y P N Q V Y Y R P V D H Y S N Q N N F V H D C V N I T V K Q H T V T T T T K G E N F T E T D I K I M E R V V E Q M C I T Q Y Q R E S Q A Y Y Q R G A S - - V I L F S S P P V I L L I S F L I F L I V G - 48 sheep Ovis aries AJ000680 AF141Q all:141 LF main pro >210_Ovi.ari.....fer.rum.ovi:: M V K S H I G S W I L V L F V A M W S D V G L C K K R P K P G G G W N T G G S R Y P G Q G S P G G N R Y P G G - S H S Q W N K P S K P K T N M K H V A G A A A A G A V V G G L G G Y M L G S A M S R P F I H F G N D Y E D R Y Y R E N M Y R Y P N Q V Y Y R P V D Q Y S N Q N N F V H D C V N I T V K Q H T V T T T T K G E N F T E T D I K I M E R V V E Q M C I T Q Y Q R E S Q A Y Y Q R G A S - - V I L F S S P P V I L L I S F L I F L I V G - 44 sheep Ovis aries AJ000737 AH154Q all:154 RH main pro >215_Ovi.ari.....fer.rum.ovi:: M V K S H I G S W I L V L F V A M W S D V G L C K K R P K P G G G W N T G G S R Y P G Q G S P G G N R Y P G G - S H S Q W N K P S K P K T N M K H V A G A A A A G A V V G G L G G Y M L G S A M S R P L I H F G N D Y E D R Y Y H E N M Y R Y P N Q V Y Y R P V D Q Y S N Q N N F V H D C V N I T V K Q H T V T T T T K G E N F T E T D I K I M E R V V E Q M C I T Q Y Q R E S Q A Y Y Q R G A S - - V I L F S S P P V I L L I S F L I F L I V G - 47 sheep Ovis aries AJ000681 AQQ211 all:211 RQ main pro >220_Ovi.ari.....fer.rum.ovi:: M V K S H I G S W I L V L F V A M W S D V G L C K K R P K P G G G W N T G G S R Y P G Q G S P G G N R Y P G G - S H S Q W N K P S K P K T N M K H V A G A A A A G A V V G G L G G Y M L G S A M S R P L I H F G N D Y E D R Y Y R E N M Y R Y P N Q V Y Y R P V D Q Y S N Q N N F V H D C V N I T V K Q H T V T T T T K G E N F T E T D I K I M E Q V V E Q M C I T Q Y Q R E S Q A Y Y Q R G A S - - V I L F S S P P V I L L I S F L I F L I V G - 41 sheep Ovis aries AJ000735 T112AQ all:112 MT main pro >225_Ovi.ari.....fer.rum.ovi:: M V K S H I G S W I L V L F V A M W S D V G L C K K R P K P G G G W N T G G S R Y P G Q G S P G G N R Y P G G - S H S Q W N K P S K P K T N T K H V A G A A A A G A V V G G L G G Y M L G S A M S R P L I H F G N D Y E D R Y Y R E N M Y R Y P N Q V Y Y R P V D Q Y S N Q N N F V H D C V N I T V K Q H T V T T T T K G E N F T E T D I K I M E R V V E Q M C I T Q Y Q R E S Q A Y Y Q R G A S - - V I L F S S P P V I L L I S F L I F L I V G - 49 sheep Ovis aries AJ000679 AT137Q all:137 MT main pro >230_Ovi.ari.....fer.rum.ovi:: M V K S H I G S W I L V L F V A M W S D V G L C K K R P K P G G G W N T G G S R Y P G Q G S P G G N R Y P G G - S H S Q W N K P S K P K T N M K H V A G A A A A G A V V G G L G G Y M L G S A T S R P L I H F G N D Y E D R Y Y R E N M Y R Y P N Q V Y Y R P V D Q Y S N Q N N F V H D C V N I T V K Q H T V T T T T K G E N F T E T D I K I M E R V V E Q M C I T Q Y Q R E S Q A Y Y Q R G A S - - V I L F S S P P V I L L I S F L I F L I V G - 42 sheep Ovis aries AJ000739 AQ P23907? wt main pro >235_Ovi.ari.....fer.rum.ovi:: M V K S H I G S W I L V L F V A M W S D V G L C K K R P K P G G G W N T G G S R Y P G Q G S P G G N R Y P G G - S H S Q W N K P S K P K T N M K H V A G A A A A G A V V G G L G G Y M L G S A M S R P L I H F G N D Y E D R Y Y R E N M Y R Y P N Q V Y Y R P V D Q Y S N Q N N F V H D C V N I T V K Q H T V T T T T K G E N F T E T D I K I M E R V V E Q M C I T Q Y Q R E S Q A Y Y Q R G A S - - V I L F S S P P V I L L I S F L I F L I V G - 117 bighorn sheep Ovis canadensis AF166334 - wt main pro >236_Ovi.can.....fer.rum.ovi:: M V K S H I G S W I L V L F V A M W S D V G L C K K R P K P G G G W N T G G S R Y P G Q G S P G G N R Y P G G - S H S Q W N K P S K P K T N M K H V A G A A A A G A V V G G L G G Y M L G S A M S R P L I H F G N D Y E D R Y Y R E N M Y R Y P N Q V Y Y R P V D Q Y S N Q N N F V H D C V N I T V K Q H T V T T T T K G E N F T E T D I K I M E R V V E Q M C I T Q Y Q R E S Q A Y Y Q R G A S V I L F S S P P V I L L I S F L I F L I V G - 68 elk Cervus elaphus nelsoni AF016228 - all:129 ML main pro >245_Cer.ela.nel.fer.rum.cer:: - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - C K K R P K P G G G W N T G G S R Y P G Q G S P G G N R Y P G G - T H S Q W N K P S K P K T N M K H V A G A A A A G A V V G G L G G Y L L G S A M S R P L I H F G N D Y E D R Y Y R E N M Y R Y P N Q V Y Y R P V D Q Y N N Q N T F V H D C V N I T V K Q H T V T T T T K G E N F T E T D I K M M E R V V E Q M C I T Q Y Q R E S E A Y Y Q R G A S - - V I L F S S P P V - - - - - - - - - - - - - - 100 elk Cervus elaphus nelsoni U21210 Cervenakova wt main pro >250_Cer.ela.nel.fer.rum.cer:: M V K S H I G S W I L V L F V A M W S D V G L C K K R P K P G G G W N T G G S R Y P G Q G S P G G N R Y P G G - T H S Q W N K P S K P K T N M K H V A G A A A A G A V V G G L G G Y M L G S A M S R P L I H F G N D Y E D R Y Y R E N M Y R Y P N Q V Y Y R P V D Q Y N N Q N T F V H D C V N I T V K Q H T V T T T T K G E N F T E T D I K M M E R V V E Q M C I T Q Y Q R E S E A Y Y Q R G A S - - V I L F S S P P V I L L I S F L I F L I V G - 82 dybowsky deer Cervus nippon dybowskii AF113941 - wt main pro >255_Cer.nip.dyb.fer.rum.cer:: - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - K K R P K P G G G W N T G G S R Y P G Q G S P G G N R Y P G G - T H S Q W N K P S K P K T N M K H V A G A A A A G A V V G G L G G Y M L G S A M S R P L I H F G N D Y E D R Y Y R E N M Y R Y P N Q V Y Y R P V D Q Y N N Q N T F V H D C V N I T V K Q H T V T T T T K G E N F T E T D I K M M - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 62 red deer Cervus elaphus Y09761 - wt main pro >260_Cer.ela.....fer.rum.cer:: M V K S H I G S W I L V L F V A M W S D V G L C K K R P K P G G G W N T G G S R Y P G Q G S P G G N R Y P G G - T H S Q W N K P S K P K T N M K H V A G A A A A G A V V G G L G G Y M L G S A M S R P L I H F G N D Y E D R Y Y R E N M Y R Y P N Q V Y Y R P V D Q Y N N Q N T F V H D C V N I T V K Q H T V T T T T K G E N F T E T D I K M M E R V V E Q M C I T Q Y Q R E S E A Y Y Q R G A S - - V I L F S S P P V I L L I S F L I F L I V G - 107 muntjak Muntiacus muntjak AF113944 - wt main pro >270_Mun.mun.....fer.rum.cer:: - - - - - - - - - - - - - - - - - W S D V G L C K K R P K P G G G W N T G G S R Y P G Q G S P G G N R Y P G G - S H S Q W N K P S K P K T N M K H V A G A A A A - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 65 mule deer Odocoileus hemionus hemionus AF009180 Allele S2 O'Rourke all:silent main pro >275_Odo.hem.hem.fer.rum.cer:: - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - C K K R P K P G G G W N T G G S R Y P G Q G S P G G N R Y P G G - T H S Q W N K P S K P K T N M K H V A G A A A A G A V V G G L G G Y M L G S A M S R P L I H F G N D Y E D R Y Y R E N M Y R Y P N Q V Y Y R P V D Q Y N N Q N T F V H D C V N I T V K Q H T V T T T T K G E N F T E T D I K M M E R V V E Q M C I T Q Y Q R E S Q A Y Y Q R G A S - - V I L F S S P P V - - - - - - - - - - - - - - 66 mule deer Odocoileus hemionus hemionus AF009181 Allele S1 O'Rourke wt main pro >280_Odo.hem.hem.fer.rum.cer:: - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - C K K R P K P G G G W N T G G S R Y P G Q G S P G G N R Y P G G - T H S Q W N K P S K P K T N M K H V A G A A A A G A V V G G L G G Y M L G S A M S R P L I H F G N D Y E D R Y Y R E N M Y R Y P N Q V Y Y R P V D Q Y N N Q N T F V H D C V N I T V K Q H T V T T T T K G E N F T E T D I K M M E R V V E Q M C I T Q Y Q R E S Q A Y Y Q R G A S - - V I L F S S P P V - - - - - - - - - - - - - - 63 mule deer Odocoileus hemionus hemionus U25965 U97331 P47852 O'Rourke 3 alleles N1 all:138 SN main pro >281_Odo.hem.hem.fer.rum.cer:: M V K S H I G S W I L V L F V A M W S D V G L C K K R P K P G G G W N T G G S R Y P G Q G S P G G N R Y P G G - T H S Q W N K P S K P K T N M K H V A G A A A A G A V V G G L G G Y M L G S A M N R P L I H F G N D Y E D R Y Y R E N M Y R Y P N Q V Y Y R P V D Q Y N N Q N T F V H D C V N I T V K Q H T V T T T T K G E N F T E T D I K M M E R V V E Q M C I T Q Y Q R E S Q A Y Y Q R G A S - - V I L F S S P P V I L L I S F L I F L I V G - 113 white-tailed deer Odocoileus virginianus AF091558 O'Rourke allele 96G-132M-138S wt main pro >285_Odo.vir....fer.rum.cer:: M V K S H I G S W I L V L F V A M W S D V G L C K K R P K P G G G W N T G G S R Y P G Q G S P G G N R Y P G G - T H S Q W N K P S K P K T N M K H V A G A A A A G A V V G G L G G Y M L G S A M S R P L I H F G N D Y E D R Y Y R E N M Y R Y P N Q V Y Y R P V D Q Y N N Q N T F V H D C V N I T V K Q H T V T T T T K G E N F T E T D I K M M E R V V E Q M C I T Q Y Q R E S Q A Y Y Q R G A S - - V I L F S S P P V I L L I S F L I F L I V G - 114 white-tailed deer Odocoileus virginianus AF091559 O'Rourke allele 96G-132M-138N all:138 SN main pro >286_Odo.vir....fer.rum.cer:: - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - C K K R P K P G G G W N T G G S R Y P G Q G S P G G N R Y P G G - T H S Q W N K P S K P K T N M K H V A G A A A A G A V V G G L G G Y M L G S A M N R P L I H F G N D Y E D R Y Y R E N M Y R Y P N Q V Y Y R P V D Q Y N N Q N T F V H D C V N I T V K Q H T V T T T T K G E N F T E T D I K M M E R V V E Q M C I T Q Y Q R E S Q A - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 115 white-tailed deer Odocoileus virginianus AF091560 O'Rourke allele 96S-132M-138S all:96 GS main pro >287_Odo.vir....fer.rum.cer:: - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - C K K R P K P G G G W N T G G S R Y P G Q G S P G G N R Y P S G - T H S Q W N K P S K P K T N M K H V A G A A A A G A V V G G L G G Y M L G S A M S R P L I H F G N D Y E D R Y Y R E N M Y R Y P N Q V Y Y R P V D Q Y N N Q N T F V H D C V N I T V K Q H T V T T T T K G E N F T E T D I K M M E R V V E Q M C I T Q Y Q R E S Q A - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 92 fallow deer Dama dama unpub.Cer01 Cervus dama Cervenakova wt main pro >295_Dam.dam.....fer.rum.cer:: M V K S H I G S W I L V L F V A M W S D V G L C K K R P K P G G G W N T G G S R Y P G Q G S P G G N R Y P G G - T H S Q W N K P S K P K T N M K H V A G A A A A G A V V G G L G G Y M L G S A M N R P L I H F G N D Y E D R Y Y R E N M Y R Y P N Q V Y Y R P V D Q Y N N Q N T F V H D C V N I T V K Q H T V T T T T K G E N F T E T D I K M M E R V V E Q M C I T Q Y Q R E S E A Y Y Q R G A S - - V I L F S S P P V I L L I S F L I F L I V G - 83 giraffe Giraffa camelopardalis reticulitis AF113942 - wt main pro >300_Gir.cam.lon.fer.rum.mis:: - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - C K K R P K P G G G W N T G G S R Y P G Q G S P G G N R Y P G G - T H G Q W N K P S K P K T N M K H M A G A A A A G A V V G G L G G Y M L G S A M S R P L I H F G N D Y E D R Y Y R E N M Y R Y P N Q V Y Y R P V D Q Y S N Q N T F V H D C V N I T V K Q H T V T T T T K G - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 84 goitered gazelle Gazella subgutturosa unpub.Sch21 - wt main pro >305_Gaz.sub.lon.fer.rum.mis:: - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - G G G W N T G G S R Y P G Q G S P G G N R Y P G G - T H S Q W N K P S K P K T N M K H V A G A A A A G A V V G G L G G Y M L G S A M S R P L I H F G N D Y E D R Y Y R E N M Y R Y P N Q V Y Y R P V D Q Y S N Q N N F V H D C V N I T V K Q H T V T T T T K G E N F T E T D I K M M E R V V E Q M C I T Q Y Q R E S Q A Y Y Q R G A S - - V I L F S S P P V I L L I S - - - - - - - - - 89 takin Budorcas taxicolor unpub.Sch26 - wt main pro >310_Bud.tax.....fer.rum.mis:: - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - P K P G G G W N T G G S R Y P G Q G S P G G N R Y P G G - S H S Q W N K P S K P K T N M K H V A G A A A A G A V V G G L G G Y M L G S A M S R P L I H F G S D Y E D R Y Y R E N M Y R Y P N Q V Y Y R P V D Q Y S N Q N N F V H D C V N I T V K Q H T V T T T T K G E N F T E T D I K I M E R V V E Q M C I T Q Y Q - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 71 addax antelope Addax nasomaculatus unpub.Sch12 - wt main pro >315_Add.nas.....fer.rum.mis:: - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - G G S R Y P G Q G S P G G N R Y P G G - T H S Q W N K P S K P K T N M K H V A G A A A A G A V V G G L G G Y M L G S A M S R P L I H F G N D Y E D R Y Y R E N M Y R Y P N Q V Y Y R P V D Q Y S N Q N N F V H D C V N I T V K Q H T V T T T T K G E N F T E T D I K I M E R V V E Q M C I T Q Y Q R E S Q A Y Y Q R - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 88 sable antelope Hippotragus niger unpub.Sch25 - wt main pro >320_Hip.nig.....fer.rum.mis:: - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - P K P G G G W N T G G S R Y P G Q G S P G G N R Y P G G - T H S Q W N K P S K P K T N M K H V A G A A A A G A V V G G L G G Y M L G S A M S R P L I H F G N D Y E D R Y Y R E N M Y R Y P N Q V Y Y R P V D Q Y S N Q N N F V H D C V N I T V K Q H T V T T T T K G E N F T E T D I K I M E R V V E Q M C I T Q Y Q R E S Q A Y Y Q R G A S - - V I L F S S P P V I L L I S F L - - - - - - - 110 arabian oryx Oryx leucoryx unsub.Poi Poidinger M Arch Virol 131 (1-2): 193-199 (1993): not submitted genbank wt main pro >325_Ory.leu.....fer.rum.mis:: M V K S H I G S W I L V L F V A M W S D V A L C K K R P K P G G G W N T G G S R Y P G Q G S P G G N R Y P G G - T H G Q W N K P S K P K T N M K H V A G A A A A G A V V G G L G G Y M L G S A M S R P L I H F G S D Y E D R Y Y R E N M Y R Y P N Q V Y Y R P V D Q Y S N Q N N F V H D C V N I T V K Q H T V T T T T K G E N F T E T D I K M M E R V V E Q M C I T Q Y Q R E S E A Y Y Q R G A S - - V I L F S S P P V I L L I S F L I F L I V G 80 bottle-nosed dolphin Tursiops truncatus unpub.Sch17 - wt main pro >330_Tur.tru.....fer.cet.dol:: - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - G G N R Y P G G G T H N Q W - K P S K P K T N M K H V A G A A A A G A V V G G L G G Y M L G S A M S R P L I H F G S D Y E D R Y Y R E N M Y R Y P N Q V Y Y R P V D Q Y N N Q N S F V H D C V K I T V K - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 102 pig Sus scrofa L07623 P49927 wt main pro >335_Sus.scr.....fer.cam.sus:: M V K S H I G G W I L V L F V A A W S D I G L C K K R P K P G G G W N T G G S R Y P G Q G S P G G N R Y P G G G S H G Q W N K P S K P K T N M K H V A G A A A A G A V V G G L G G Y M L G S A M S R P L I H F G S D Y E D R Y Y R E N M Y R Y P N Q V Y Y R P V D Q Y S N Q N S F V H D C V N I T V K Q H T V T T T T K G E N F T E T D V K M I E R V V E Q M C I T Q Y Q K E Y E A Y A Q R G A S - - V I L F S S P P V I L L I S F L L F L I V G - 69 camel Camelus dromedarius Y09760 - wt main pro >340_Cam.dro.....fer.cam.cam:: M V K S H M G S W I L V L F V V T W S D V G L C K K R P K P G G G W N T G G S R Y P G Q G S P G G N R Y P G G G A H G Q W N K P S K P K T S M K H V A G A A A A G A V V G G L G G Y M L G S A M S R P L I H F G N D Y E D R Y Y R E N M Y R Y P N Q V Y Y K P V D Q Y S N Q N S F V H D C V N I T V K Q H T V T T T T K G E N F T E T D V K M M E R V V E Q M C I T Q Y Q R E Y Q A S Y G R G A S - - V I - F S S P P V I L L I S F L I F L I V G - 81 camel Camelus dromedarius AF113940 - all:209 delM main pro >345_Cam.dro.....fer.cam.cam:: - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - G S R Y P G Q G S P G G N R Y P G G G A H G Q W N K P S K P K T S M K H V A G A A A A G A V V G G L G G Y M L G S A M S R P L I H F G N D Y E D R Y Y R E N M Y R Y P N Q V Y Y K P V D Q Y S N Q N S F V H D C V N I T V K Q H T V T T T T K G E N F T E T D V K - M E R V V E Q M C I T Q Y Q R E Y Q A S Y G R G A S - - V I - F S S P P V I L L I S - - - - - - - - - 85 llama Lama glama AF113943 - wt main pro >350_Lam.gla.....fer.cam.lam:: - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - G N R Y P G G G T H G Q W N K P S K P K T S M K H V A G A A A A G A V V G G L G G Y M L G S A M S R P L I H F G N D Y E D R Y Y R E N M Y R Y P N Q V Y Y K P V D Q Y S N Q N S F V H D C V N I T V K Q H T V T T T T K G E N F T E T D V K M M E R V V E Q M C I T Q Y Q R E Y Q A S Y G R G A S - - V I - F S S P P V - - - - - - - - - - - - - - 79 horse Equus familiaris caballus unpub.Sch16 - wt main pro >360_Equ.fam.cab.fer.per.hor:: - - - - - - - - - - - - - - - - T W S D V G L C K K R P K P G G G W N T G G S R Y P G Q G S P G G N R Y P G G - S H G Q W N K P S K P K T N M K H V A G A A A A G A V V G G L G G Y M L G S A M S R P L I H F G N D Y E D R Y Y R E N M Y R Y P N Q V Y Y R P V S E Y S N Q K N F V H D C V N I T V K Q H T V T T T T K G E N F T E T D V K I M E R V V E Q M C I T Q Y Q K E Y E A F Q Q R G A S - - V V L F S S P P V - - - - - - - - - - - - - - 106 zebra Equus quagga boehmi unpub.Sch04 - wt main pro >365_Equ.qua.boe.fer.per.hor:: - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - K R P K P G G - W N T G G S R Y P G Q G S P G G N R Y P G G - S H G Q W N K P S K P K T N M K H V A G A A A A G A V V G G L G G Y M L G S A M S R P L I H F G N D Y E D R Y Y R E N M Y R Y P N Q V Y Y R P V S E Y S N Q N N F V H D C V N I T V K Q H T V T T T T K G E N F T E T D V K I M E R V V E Q M C I T Q Y Q K E Y E A F Q Q R G A S - - V V L F S S P P V I L L I S - - - - - - - - - 77 canadian wolf Canis lupus canadensis AF113939 - wt main pro >370_Can.lup.fam.fer.car.dog:: - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - P G Q G S P G G N R Y P G G G S H S Q W G K P N K P K T N M K H V A G A A A A G A V V G G L G G Y M L G S A M S R P L I H F G N D Y E D R Y Y R E N M Y R Y P D Q V Y Y R P V D Q Y S N Q N N F V R D C V N I T V K Q H T V T T T T K G E N F T E T D M K I M E R V V E Q M C V T Q Y Q K E S E A Y Y Q R G A S - - A - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 76 dog Canis lupus familiaris AF042843 - wt main pro >375_Can.lup.fam.fer.car.dog:: M V K S H I G G W I L L L F V A T W S D V G L C K K R P K P G G G W N T G G S R Y P G Q G S P G G N R Y P G G G S H S Q W G K P N K P K T N M K H V A G A A A A G A V V G G L G G Y M L G S A M S R P L I H F G N D Y E D R Y Y R E N M Y R Y P E Q V Y Y R P V D Q Y S N Q N N F V R D C V N I T V K Q H T V T T T T K G E N F T E T D M K I M E R V V E Q M C V T Q Y Q K E S E A Y Y Q R G A S - - A I L F S P P P V I L L I S L L I L L I V G - 112 dog (greyhound) Canis lupus familiaris AF113938 - wt main pro >381_Can.lup.fam.fer.car.dog:: - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - P G Q G S P G G N R Y P G G G S H S Q W G K P N K P K T N M K H V A G A A A A G A V V G G L G G Y M L G S A M S R P L I H F G N D Y E D R Y Y R E N M Y R Y P D Q V Y Y R P V D Q Y S N Q N N F V R D C V N I T V K H H T V T T T T K G E N F T E T D M K I M E R V V E Q M C V T Q Y Q K E S E A Y Y Q R G A S - - A I L F S P P P V I L L I S L L I L L I - - - 78 dingo Canis lupus hallstromii AF113937 - wt main pro >385_Can.lup.hal.fer.car.dog:: - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - P G Q G S P G G N R Y P G G G S H S Q W G K P N K P K T N M K H V A G A A A A G A V V G G L G G Y M L G S A M S R P L I H F G N D Y E D R Y Y R E N M Y R Y P D Q V Y Y R P V D Q Y S N Q N N F V R D C V N I T V K H H T V T T T T K G E N F T E T D M K I M E R V V E Q M C V T Q Y Q K E S E A Y Y Q R G A S - - A I L F S P P P V I L L I S L L I L L I - - - 74 cat Felis catus Y13698 - wt main pro >390_Fel.cat.....fer.car.cat:: - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - N M K H V A G A A A A G A V V G G L G G Y M L G S A M S R P L I H F G N D Y E D R Y Y R E N M Y R Y P D Q V Y Y R P V D Q Y S N Q N N F V R D C V N I T V K Q R T V T T T T K G E N F T E T D M K I M E R V V E Q M C V T Q Y Q K E S E A Y Y Q R R A S - - A - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 75 cat Felis catus AF003087 - wt main pro >395_Fel.cat.....fer.car.cat:: M V K S H I G S W I L V L F V A M W S D V G L C K K R P K P G G G W N T G G S R Y P G Q G S P G G N R Y P G G - S H S Q W N K P S K P K T N M K H V A G A A A A G A V V G G L G G Y M L G S A M S R P L I H F G N D Y E D R Y Y R E N M Y R Y P N Q V Y Y R P V D Q Y S N Q N N F V H D C V N I T V K Q H T V T T T T K G E N F T E T D I K I M E R V V E Q M C I T Q Y Q R E S E A Y Y Q R G A S - - V I L F S S P P V I L L I S F L I F L I V G - 103 polecat Mustela putorius U08952 P52114 wt main pro >400_Mus.put.....fer.car.mnk:: M V K S H I G S W L L V L F V A T W S D I G F C K K R P K P G G G W N T G G S R Y P G Q G S P G G N R Y P G G G S H G Q W G K P S K P K T N M K H V A G A A A A G A V V G G L G G Y M L G S A M S R P L I H F G N D Y E D R Y Y R E N M Y R Y P N Q V Y Y K P V D Q Y S N Q N N L V H D C V N I T V K Q H T V T T T T K G E N F T E T D M K I M E R V V E Q M C V T Q Y Q Q E S E A Y Y Q R G A S - - A I L F S P P P V I L L I S L L I L L I V G - 73 mink Mustela vison S46825 P40244 wt main pro >410_Mus.vis.....fer.car.mnk:: M V K S H I G S W L L V L F V A T W S D I G F C K K R P K P G G G W N T G G S R Y P G Q G S P G G N R Y P G G G S H G Q W G K P S K P K T N M K H V A G A A A A G A V V G G L G G Y M L G S A M S R P L I H F G N D Y E D R Y Y R E N M Y R Y P N Q V Y Y K P V D Q Y S N Q N N F V H D C V N I T V K Q H T V T T T T K G E N F T E T D M K I M E R V V E Q M C V T Q Y Q R E S E A Y Y Q R G A S - - A I L F S P P P V I L L I S L L I L L I V G - 10 night monkey Aotus trivirgatus U08293 P40245 wt main pro >415_Aot.tri.....pri.nwm.mon:: - - - - - - - - - M L V L F V A T W S D L G L C K K R P K P G G - W N T G G S R Y P G Q S S P G G N R Y P G G G T H N Q W N K P S K P K T N M K H M A G A A A A G A V V G G L G G Y M L G S A M S R P L I H F G N D Y E D R Y Y R E N M Y R Y P N Q V Y Y R P V D Q Y S N Q N N F V H D C V N I T I K Q H T V T T T T K G E N F T E T D V K I M E R V V E Q M C I T Q Y E K E S Q A Y Y Q R G S S - - M V L F S S P P V I L L I S F L - - - - - - - 24 black-handed spider monkey Ateles geoffroyi U08309 P40246 wt main pro >420_Ate.geo.....pri.nwm.mon:: - - - - - - - - - M L V L F V A T W S D L G L C K K R P K P G G - W N T G G S R Y P G Q G S P G G N R Y P G G G T H N Q W N K P S K P K T N M K H M A G A A A A G A V V G G L G G Y M L G S A M S R P L I H F G N D Y E D R Y Y R E N M Y R Y P N Q V Y Y R P V D Q Y N N Q N N F V H D C V N I T I K Q H T V T T T T K G E N F T E T D V K M M E R V V E Q M C I T Q Y E R E S Q A Y Y Q R G S S - - M V L F S S P P V I L L I S F L I - - - - - - 25 black spider x b-h spider Ateles paniscus x Ateles fusciceps U15164 P51446 wt main pro >425_Ate.pan.....pri.nwm.mon:: M A - - N L G Y W M L V L F V A T W S D L G L C K K R P K P G G - W N T G G S R Y P G Q G S P G G N R Y P A G G T H N Q W N K P S K P K T N M K H M A G A A A A G A V V G G L G G Y M L G S A M S R P L I H F G N D Y E D R Y Y R E N M Y R Y P N Q V Y Y R P V D Q Y N N Q N N F V H D C V N I T I K Q H T V T T T T K G E N L T E T D V K M M E R V V E Q M C I T Q Y E R E S Q A Y Y Q R G S S - - M V L F S S P P V I L L I S F L I F L I V G - 27 marmoset Callithrix jacchus U08304 P40247 wt main pro >430_Cal.jac.....pri.nwm.mon:: M A - - N L G C W M L F L F V A T W S D L G L C K K R P K P G G - W N T G G S R Y P G Q G S P G G N R Y P G G G T H S Q W N K P S K P K T N M K H V A G A A A A G A V V G G L G G Y M L G S A M S R P L I H F G N D Y E D R Y Y R E N M Y R Y P N Q V Y Y R P V D Q Y N N Q N N F V H D C V N I T I K Q H T V T T T T K G E N F T E T D V K M M E R V V E Q M C I T Q Y E K E S Q A Y Y Q R G S S - - M V L F S S P P V I L L I S F L I F L I V G - 26 brown-capped capuchin Cebus apella U08295 P40249 wt main pro >435_Ceb.ape.....pri.nwm.mon:: M A - - N L G C W M L V L F V A T W S D L G L C K K R P K P G G - W N T G G S R Y P G Q G S P G G N L Y P G G G T H N Q W N K P S K P K T S M K H V A G A A A A G A V V G G L G G Y M L G S A M S R P L I H F G N D Y E D R Y Y R E N M Y R Y P N Q V Y Y R P V D Q Y S N Q N N F V H D C V N I T I K Q H T V T T T T K G E N F T E T D V K M M E R V V E Q M C I T Q Y E R E S Q A Y Y Q R G S S - - M V L F S S P P V I L L I S F L I F L I V G - 28 squirrel monkey Saimiri sciureus U08310 P40258 all:long main pro >440_Sai.sci.lon.pri.nwm.mon:: M A - - N L G C W M L V L F V A T W S D L G L C K K R P K P G G - W N T G G S R Y P G Q G S P G G N R Y P G G G T H N Q W N K P S K P K T N M K H M A G A A A A G A V V G G L G G Y M L G S A M S R P L I H F G N D Y E D R Y Y R E N M Y R Y P S Q V Y Y R P V D Q Y S N Q N N F V H D C V N V T I K Q H T V T T T T K G E N F T E T D V K M M E R V V E Q M C I T Q Y E K E S Q A Y Y Q R G S S - - M V L F S S P P V I L L I S F L I F L I V G - 29 squirrel monkey Saimiri sciureus U15165 - wt main pro >445_prosimian M A - - N L G Y W M L V L F V A T W S D L G L C K K R P K P G G - W N T G G S R Y P G Q G S P G G N R Y P G G G T H N Q W N K P S K P K T N M K H M A G A A A A G A V V G G L G G Y M L G S A M S R P L I H F G N D Y E D R Y Y R E N M Y R Y P N Q V Y Y R P V D Q Y S N Q N N F V H D C V N I T I K Q H T V T T T T K G E N F T E T D V K M M E R V V E Q M C I T Q Y E K E S Q A Y Y Q R G S S - - M V L F S S P P V I L L I S F L I F L I V G - 29 squirrel monkey Saimiri sciureus U15165 - wt main pro >445_Sai.sci.....pri.nwm.mon:: M A - - N L G Y W M L V L F V A T W S D L G L C K K R P K P G G - W N T G G S R Y P G Q G S P G G N R Y P G G G T H N Q W N K P S K P K T N M K H M A G A A A A G A V V G G L G G Y M L G S A M S R P L I H F G N D Y E D R Y Y R E N M Y R Y P S Q V Y Y K P V D Q Y S N Q N N F V H D C V N V T I K Q H T V T T T T K G E N F T E T D V K M M E R V V E Q M C I T Q Y E K E S Q A Y Y Q R G S S - - M V L F S S P P V I L L I S F L I F L I V G - 16 gelada baboon Theropithecus gelada U75383 TGU75383 U75383 g1658480 wt main pro >450_The.gel.....pri.owm.mon:: - - - - - - - - - M L V L F V A T W S D L G L C K K R P K P G G - W N T G G S R Y P G Q G S P G G N R Y P G G G T H N Q W H K P S K P K T S M K H M A G A A A A G A V V G G L G G Y M L G S A M S R P L I H F G N D Y E D R Y Y R E N M Y R Y P N Q V Y Y R P V D Q Y S N Q N N F V H D C V N I T I K Q H T V T T T T K G E N F T E T D V K M M E R V V E Q M C I T Q Y Q K E S Q A Y Y Q R G S S - - I V L F S S P P V I L L I S F L I F L I V G - 93 dusky titi Callicebus moloch U08312 P40248 wt main pro >455_Cal.mol.....pri.owm.mon:: - - - - - - - - - M L V L F V A T W S D L G L C K K R P K P G G - W N T G G S R Y P G Q G S P G G N R Y P G G G T H N Q W N K P S K P K T N M K H V A G A A A A G A V V G G L G G Y M L G S A M S R P L I H F G N D Y E D R Y Y R E N M Y R Y P N Q V Y Y R P V D Q Y S N Q N N F V H D C V N I T I K Q H T V T T T T K G E N F T E T D V K M M E R V V E Q M C I T Q Y E K E S Q A Y Y Q R G S S - - M V L F S S P P V I L L I S F L I - - - - - - 1 green monkey or grivet Cercopithecus aethiops U08291 P40250 wt main pro >460_Cer.aet.....pri.owm.mon:: M A - - N L G C W M L V V F V A T W S D L G L C K K R P K P G G - W N T G G S R Y P G Q G S P G G N R Y P G G G T H N Q W H K P S K P K T S M K H M A G A A A A G A V V G G L G G Y M L G S A M S R P L I H F G N D Y E D R Y Y R E N M Y R Y P N Q V Y Y R P V D Q Y S N Q N N F V H D C V N I T I K Q H T V T T T T K G E N F T E T D V K M M E R V V E Q M C I T Q Y E K E S Q A Y Y Q R G S S - - M V L F S S P P V I L L I S F L I F L I V G - 3 mangabey Cercocebus aterrimus U75384 van der Kuyl g1658467 CAU75384 U75384 g1658466 wt main pro >465_Cer.ate.....pri.owm.mon:: - - - - - - - - - M L V L F V A T W S D L G L C K K R P K P G G - W N T G G S R Y P G Q G S P G G N R Y P G G G T H N Q W H K P S K P K T S M K H M A G A A A A G A V V G G L G G Y M L G S A M S R P L I H F G N D Y E D R Y Y R E N M Y R Y P N Q V Y Y R P V D Q Y S N Q N N F V H D C V N I T I K Q H T V T T T T K G E N F T E T D V K M M E R V V E Q M C I T Q Y E K E S Q A Y Y Q R G S S - - M V L F S S P P V I L L I S F L I F L I V G - 98 diana monkey Cercopithecus dianae U08292 - wt main pro >470_Cer.dia.....pri.owm.bab:: M A - - N L G C W M L V V F V A T W S D L G L C K K R P K P G G - W N T G G S R Y P G Q G S P G G N R Y P G G G T H N Q W H K P S K P K T S M K H M A G A A A A G A V V G G L G G Y M L G S A M S R P L I H F G N D Y E D R Y Y R E N M Y R Y P N Q V Y Y R P V D Q Y S N Q N N F V H D C V N I T I K Q H T V T T T T K G E N F T E T D V K M M E R V V E Q M C I T Q Y E K E S Q A Y Y Q R G S S - - M V L F S S P P V I L L I S F L I F L I V G - 4 baboon Cercopithecus mona U75386 van der Kuyl g1658471 CMU75386 U75386 g1658470 wt main pro >475_Cer.mon.....pri.owm.bab:: - - - - - - - - - M L V L F V A T W S D L G L C K K R P K P G G - W N T G G S R Y P G Q G S P G G N R Y P G G G T H N Q W H K P S K P K T S M K H M A G A A A A G A V V G G L G G Y M L G S A M S R P L I H F G N D Y E D R Y Y R E N M Y R Y P N Q V Y Y R P V D Q Y S N Q N N F V H D C V N I T I K Q H T V T T T T K G E N F T E T D V K M M E R V V E Q M C I T Q Y E K E S Q A Y Y Q R G S S - - M V L F S S P P V I L L I S F L I F L I V G - 5 neglected monkey Cercopithecus neglectus U75387 van der Kuyl g1658473 CNU75387 U75387 g1658472 wt main pro >480_Cer.neg.....pri.owm.bab:: - - - - - - - - - M L V L F V A T W S D L G L C K K R P K P G G - W N T G G S R Y P G Q G S P G G N R Y P G G G T H N Q W H K P S K P K T S M K H M A G A A A A G A V V G G L G G Y M L G S A M S R P L I H F G N D Y E D R Y Y R E N M Y R Y P N Q V Y Y R P V D Q Y S N Q N N F V H D C V N I T I K Q H T V T T T T K G E N F T E T D V K M M E R V V E Q M C I T Q Y E K E S Q A Y Y Q R G S S - - M V L F S S P P V I L L I S F L I F L I V G - 6 patas monkey Cercopithecus patas U75388 van der Kuyl g1658475 CPU75388 U75388 g1658474 wt main pro >485_Cer.pat.....pri.owm.bab:: - - - - - - - - - M L V L F V A T W S D L G L C K K R P K P G G - W N T G G S R Y P G Q G S P G G N R Y P G G G T H N Q W H K P S K P K T S M K H M A G A A A A G A V V G G L G G Y M L G S A M S R P L I H F G N E Y E D R Y Y R E N M Y R Y P N Q V Y Y R P V D Q Y S N Q N N F V H D C V N I T I K Q H T V T T T T K G E N F T E T D V K M M E R V V E Q M C I T Q Y E K E S Q A Y Y Q R G S S - - M V L F S S P P V I L L I S F L I F L I V G - 14 sooty mangabey Cercocebus torquatus atys U75385 g1658477 wt main pro >490_Cer.tor.....pri.owm.mon:: - - - - - - - - - M L V L F V A T W S D L G L C K K R P K P G G - W N T G G S R Y P G Q G S P G G N R Y P G G G T H N Q W H K P S K P K T S M K H M A G A A A A G A V V G G L G G Y M L G S A M S R P L I H F G N E Y E D R Y Y R E N M Y R Y P N Q V Y Y R P V D Q Y S N Q N N F V H D C V N I T I K Q H T V T T T T K G E N F T E T D V K M M E R V V E Q M C I T Q Y E K E S Q A Y Y Q R G S S - - M V L F S S P P V I L L I S F L I F L I V G - 7 colubus Colobus guereza U08297 P40251 wt main pro >495_Col.gue.....pri.owm.mon:: M A - - N L G C W M L V L F V A T W S D L G L C K K R P K P G G - W N T G G S R Y P G Q G S P G G N R Y P G G G T H S Q W N K P S K P K T S M K H M A G A A A A G A V V G G L G G Y M L G S A M S R P L I H F G N D Y E D R Y Y R E N M Y R Y P N Q V Y Y R P V D Q Y S N Q N N F V H D C V N I T I K Q H T V T T T T K G E N F T E T D V K M M E R V V E Q M C I T Q Y E K E S Q A Y Y Q R G S S - - M V L F S S P P V I L L I S F L I F L I V G - 15 stump-tailed macaque Macaca arctoides U08311 - wt main pro >505_Mac.arc.....pri.owm.mac:: M A - - N L G C W M L V L F V A T W S D L G L C K K R P K P G G - W N T G G S R Y P G Q G S P G G N R Y P G G G T H N Q W H K P S K P K T S M K H M A G A A A A G A V V G G L G G Y M L G S A M S R P L I H F G N D Y E D R Y Y R E N M Y R Y P N Q V Y Y R P V D Q Y S N Q N N F V H D C V N I T I K Q H T V T T T T K G E N F T E T D V K M M E R V V E Q M C I T Q Y E K E S Q A Y Y Q R G S S - - M V L F S S P P V I L L I S F L I F L I V G - 9 crab-eating macaque Macaca fascicularis U08298 P40254 wt main pro >510_Mac.fas.....pri.owm.mac:: M A - - N L G C W M L V L F V A T W S D L G L C K K R P K P G G - W N T G G S R Y P G Q G S P G G N R Y P G G G T H N Q W H K P S K P K T S M K H M A G A A A A G A V V G G L G G Y M L G S A M S R P L I H F G N D Y E D R Y Y R E N M Y R Y P N Q V Y Y R P V D Q Y S N Q N N F V H D C V N I T I K Q H T V T T T T K G E N F T E T D V K M M E R V V E Q M C I T Q Y E K E S Q A Y Y Q R G S S - - M V L F S S P P V I L L I S F L I F L I V G - 97 japanese macaque Macaca fuscata U08301 - wt main pro >515_Mac.fus.....pri.owm.mac:: M A - - N L G C W M L V L F V A T W S D L G L C K K R P K P G G - W N T G G S R Y P G Q G S P G G N R Y P G G G T H N Q W H K P S K P K T S M K H M A G A A A A G A V V G G L G G Y M L G S A M S R P L I H F G N D Y E D R Y Y R E N M Y R Y P N Q V Y Y R P V D Q Y S N Q N N F V H D C V N I T I K Q H T V T T T T K G E N F T E T D V K M M E R V V E Q M C I T Q Y E K E S Q A Y Y Q R G S S - - M V L F S S P P V I L L I S F L I F L I V G - 99 rhesus macaque Macaca mulatta U15163 Cervenakova wt main pro >525_Mac.mul.....pri.owm.mac:: M A - - N L G C W M L V L F V A T W S D L G L C K K R P K P G G - W N T G G S R Y P G Q G S P G G N R Y P G G G T H N Q W H K P S K P K T S M K H M A G A A A A G A V V G G L G G Y M L G S A M S R P L I H F G N D Y E D R Y Y R E N M Y R Y P N Q V Y Y R P V D Q Y S N Q N N F V H D C V N I T I K Q H T V T T T T K G E N F T E T D V K M M E R V V E Q M C I T Q Y E K E S Q A Y Y Q R G S S - - M V L F S S P P V I L L I S F L I F L I V G - 96 pig-tailed macaque Macaca nemestrina U08306 - wt main pro >530_Mac.nem.....pri.owm.mac:: M A - - N L G C W M L V L F V A T W S D L G L C K K R P K P G G - W N T G G S R Y P G Q G S P G G N R Y P G G G T H N Q W H K P S K P K T S M K H M A G A A A A G A V V G G L G G Y M L G S A M S R P L I H F G N D Y E D R Y Y R E N M Y R Y P N Q V Y Y R P V D Q Y S N Q N N F V H D C V N I T I K Q H T V T T T T K G E N F T E T D V K M M E R V V E Q M C I T Q Y E K E S Q A Y Y Q R G S S - - M V L F S S P P V I L L I S F L I F L I V G - 2 barbary macaque Macaca sylvanus U75382 van der Kuyl g1658479 wt main pro >535_Mac.syl.....pri.owm.mac:: - - - - - - - - - M L V L F V A T W S D L G L C K K R P K P G G - W N T G G S R Y P G Q G S P G G N R Y P G G G T H N Q W H K P S K P K T S M K H M A G A A A A G A V V G G L G G Y M L G S A M S R P L I H F G N D Y E D R Y Y R E N M Y R Y P N Q V Y Y R P V D Q Y S N Q N N F V H D C V N I T I K Q H T V T T T T K G E N F T E T D V K M M E R V V E Q M C I T Q Y E K E S Q A Y Y Q R G S S - - M V L F S S P P V I L L I S F L I F L I V G - 11 mandrill Mandrillus sphinx U08303 P40255 wt main pro >540_Man.sph.....pri.owm.mon:: - - - - - - - - - M L V L F V A T W S D L G L C K K R P K P G G - W N T G G S R Y P G Q G S P G G N R Y P G G G T H N Q W H K P N K P K T S M K H M A G A A A A G A V V G G L G G Y M L G S A M S R P L I H F G N D Y E D R Y Y R E N M Y R Y P N Q V Y Y R P V D Q Y S N Q N N F V H D C V N I T I K Q H T V T T T T K G E N F T E T D V K M M E R V V E Q M C I T Q Y E K E S Q A Y Y Q R G S S - - M V L F S S P P V I L L I S F L I - - - - - - 12 hamadryas baboon Papio hamadryas U08294 - wt main pro >545_Pap.ham.....pri.owm.mon:: M A - - N L G C W M L V L F V A T W S D L G L C K K R P K P G G - W N T G G S R Y P G Q G S P G G N R Y P G G G T H N Q W H K P S K P K T S M K H M A G A A A A G A V V G G L G G Y M L G S A M S R P L I H F G N D Y E D R Y Y R E N M Y R Y P N Q V Y Y R P V D Q Y S N Q N N F V H D C V N I T I K Q H T V T T T T K G E N F T E T D V K M M E R V V E Q M C I T Q Y E K E S Q A Y Y Q R G S S - - M V L F S S P P V I L L I S F L I F L I V G - 13 langur Presbytis francoisi U08302 P40257 wt main pro >550_Pre.fra.....pri.owm.mon:: M A - - N L G C W M L V L F V A T W S D L G L C K K R P K P G G - W N T G G S R Y P G Q G S P G G N R Y P G G G T H S Q W N K P S K P K T S M K H M A G A A A A G A V V G G L G G Y M L G S A M S R P L I H F G N D Y E D R Y Y R E N M Y R Y P N Q V Y Y R P V D Q Y S N Q N N F V H D C V N I T I K Q H T V T T T T K G E N F T E T D V K M M E R V V E Q M C I T Q Y E K E S Q A Y Y Q R G S S - - M V F F S S P P V I L L I S F L I F L I V G - 118 lemur Varecia variegata variegata AF177293 - wt main pro >553_Var.var.....pri.owa.lem:: - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - G G G S H G Q W N K P S K P K T N M K H V A G A A A A G A V V G G L G G Y M L G S A M S R P L I H F G N D Y E D R Y Y R E N M Y R Y P N Q V Y Y K P V D Q Y S N Q N S F V H D C V N I T I K Q H T V T T 18 gorilla Gorilla gorilla U08300 P40252 wt main pro >555_Gor.gor.....pri.owa.ape:: M A - - N L G C W M L V L F V A T W S D L G L C K K R P K P G G - W N T G G S R Y P G Q G S P G G N R Y P G G G T H S Q W N K P S K P K T N M K H M A G A A A A G A V V G G L G G Y M L G S A M S R P I I H F G S D Y E D R Y Y R E N M H R Y P N Q V Y Y R P M D Q Y S N Q N N F V H D C V N I T I K Q H T V T T T T K G E N F T E T D V K M M E R V V E Q M C I T Q Y E R E S Q A Y Y Q R G S S - - M V L F S S P P V I L L I S F L I F L I V G - 19 gorilla Gorilla gorilla U15166 - all:6 CY main pro >560_Gor.gor.....pri.owa.ape:: M A - - N L G Y W M L V L F V A T W S D L G L C K K R P K P G G - W N T G G S R Y P G Q G S P G G N R Y P G G G T H S Q W N K P S K P K T N M K H M A G A A A A G A V V G G L G G Y M L G S A M S R P I I H F G S D Y E D R Y Y R E N M H R Y P N Q V Y Y R P M D Q Y S N Q N N F V H D C V N I T I K Q H T V T T T T K G E N F T E T D V K M M E R V V E Q M C I T Q Y E R E S Q A Y Y Q R G S S - - M V L F S S P P V I L L I S F L I F L I V G - 21 human Homo sapiens M13899 - wt main pro >565_Hom.sap.....pri.owa.ape:: M A - - N L G C W M L V L F V A T W S D L G L C K K R P K P G G - W N T G G S R Y P G Q G S P G G N R Y P G G G T H S Q W N K P S K P K T N M K H M A G A A A A G A V V G G L G G Y M L G S A M S R P I I H F G S D Y E D R Y Y R E N M H R Y P N Q V Y Y R P M D E Y S N Q N N F V H D C V N I T I K Q H T V T T T T K G E N F T E T D V K M M E R V V E Q M C I T Q Y E R E S Q A Y Y Q R G S S - - M V L F S S P P V I L L I S F L I F L I V G - 999 human Homo sapiens M13899 - all:22 main pro >566_Hom.sap.....pri.owa.ape:: M A - - N L G C W M L V L F V A T W S D L G L C K K R P K P G G - W N T G G S R Y P G Q G S P G G N R Y P G G G T H S Q W N K L S K L K T N M K H M A G A A V A G A V V G G L G G Y V L G S A M S R P I I H F G S D - E D R Y Y R E N M H R Y P N Q V Y Y R P M D E Y S S Q N N F V H N C I N I A I K Q R T V T T T T K G E N S T E T N V K M M E H V I E P M C I T R Y K R E S Q A Y Y Q R G S S - - R V L F S S P P V I L L I S F L I F L I V G - 17 malayan gibbon Hylobates lar U08299 - wt main pro >570_Hya.lar.....pri.owa.ape:: M A - - N L G C W M L V L F V A T W S D L G L C K K R P K P G G - W N T G G S R Y P G Q G S P G G N R Y P G G G T H S Q W N K P S K P K T N M K H M A G A A A A G A V V G G L G G Y M L G S A M S R P I I H F G S D Y E D R Y Y R E N M H R Y P N Q V Y Y R P M D Q Y S S Q N N F V H D C V N I T I K Q H T V T T T T K G E N F T E T D V K M M E R V V E Q M C I T Q Y E R E S Q A Y Y Q R G S S - - M V L F S S P P V I L L I S F L I F L I V G - 20 chimpanzee Pan troglodytes U08296 P40253 wt main pro >575_Pan.tro.....pri.owa.ape:: M A - - N L G C W M L V L F V A T W S D L G L C K K R P K P G G - W N T G G S R Y P G Q G S P G G N R Y P G G G T H S Q W N K P S K P K T N M K H M A G A A A A G A V V G G L G G Y M L G S A M S R P I I H F G S D Y E D R Y Y R E N M H R Y P N Q V Y Y R P M D Q Y S S Q N N F V H D C V N I T I K Q H T V T T T T K G E N F T E T D V K M M E R V V E Q M C I T Q Y E R E S Q A Y Y Q R G S S - - M V L F S S P P V I L L I S F L I F L I V G - 22 orangutan Pongo pygmaeus U08305 P40256 wt main pro >585_Pon.pyg.....pri.owa.ape:: M A - - N L G C W M L V L F V A T W S D L G L C K K R P K P G G - W N T G G S R Y P G Q G S P G G N R Y P G G G T H S Q W N K P S K P K T N M K H M A G A A A A G A V V G G L G G Y M L G S A M S R P I I H F G S D Y E D R Y Y R E N M H R Y P N Q V Y Y R P M D Q Y S S Q N N F V H D C V N I T I K Q H T V T T T T K G E N F T E T D V K M M E R V V E Q M C I T Q Y E R E S Q A Y Y Q R G S S - - M V L F S S P P V I L L I S F L I F L I V G - 94 siamang Symphalangus syndactylus U08308 Hylobates syndactylus? wt main pro >590_Sym.syn.....pri.owa.ape:: M A - - N L G C W M L V L F V A T W S D L G L C K K R P K P G G - W N T G G S R Y P G Q G S P G G N R Y P G G G T H S Q W N K P S K P K T N M K H M A G A A A A G A V V G G L G G Y M L G S A M S R P I I H F G S D Y E D R Y Y R E N M H R Y P N Q V Y Y R P M D Q Y S S Q N N F V H D C V N I T I K Q H T V T T T T K G E N F T E T D V K M M E R V V E Q M C I T Q Y E R E S Q A Y Y Q R G S S - - M V L F S S P P V I L L I S F L I F L I V G - 31 golden syrian hamster Mesocricetus auratus U78769 P04273 wt main pro >600_Mes.aur.....rod.mur.ham:: M A - - N L S Y W L L A L F V A M W T D V G L C K K R P K P G G - W N T G G S R Y P G Q G S P G G N R Y P G G G T H N Q W N K P S K P K T N M K H M A G A A A A G A V V G G L G G Y M L G S A M S R P M M H F G N D W E D R Y Y R E N M N R Y P N Q V Y Y R P V D Q Y N N Q N N F V H D C V N I T I K Q H T V T T T T K G E N F T E T D I K I M E R V V E Q M C T T Q Y Q K E S Q A Y Y D G R R S S - A V L F S S P P V I L L I S F L I F L M V G - 39 mouse Mus musculus M18071 long P04925 all:108LF+189TV main pro >600_Mus.mus.lon.rod.mur.mus:: M A - - N L G Y W L L A L F V T M W T D V G L C K K R P K P G G - W N T G G S R Y P G Q G S P G G N R Y P G G G T H N Q W N K P S K P K T N F K H V A G A A A A G A V V G G L G G Y M L G S A M S R P M I H F G N D W E D R Y Y R E N M Y R Y P N Q V Y Y R P V D Q Y S N Q N N F V H D C V N I T I K Q H T V V T T T K G E N F T E T D V K M M E R V V E Q M C V T Q Y Q K E S Q A Y Y D G R R S S S T V L F S S P P V I L L I S F L I F L I V G - 37 mouse Mus musculus M18070 short PRIO_MOUSE P04925 DC2236E3CRC32 wt main pro >605_Mus.mus.sho.rod.mur.mus:: M A - - N L G Y W L L A L F V T M W T D V G L C K K R P K P G G - W N T G G S R Y P G Q G S P G G N R Y P G G G T H N Q W N K P S K P K T N L K H V A G A A A A G A V V G G L G G Y M L G S A M S R P M I H F G N D W E D R Y Y R E N M Y R Y P N Q V Y Y R P V D Q Y S N Q N N F V H D C V N I T I K Q H T V T T T T K G E N F T E T D V K M M E R V V E Q M C V T Q Y Q K E S Q A Y Y D G R R S S S T V L F S S P P V I L L I S F L I F L I V G - 38 mouse Mus musculus M13685 M136V 1986 strain all:136 MV main pro >610_Mus.mus.mtv.rod.mur.mus:: M A - - N L G Y W L L A L F V T M W T D V G L C K K R P K P G G - W N T G G S R Y P G Q G S P G G N R Y P G G G T H N Q W N K P S K P K T N L K H V A G A A A A G A V V G G L G G Y M L G S A V S R P M I H F G N D W E D R Y Y R E N M Y R Y P N Q V Y Y R P V D Q Y S N Q N N F V H D C V N I T I K Q H T V T T T T K G E N F T E T D V K M M E R V V E Q M C V T Q Y Q K E S Q A Y Y D G R R S S S T V L F S S P P V I L L I S F L I F L I V G - 40 rat Rattus norvegicus D50093 P13852 D50092S2 A53892 ? wt main pro >615_Rat.nor.....rod.mur.rat:: M A - - N L G Y W L L A L F V T T C T D V G L C K K R P K P G G - W N T G G S R Y P G Q G S P G G N R Y P G G G T H N Q W N K P S K P K T N L K H V A G A A A A G A V V G G L G G Y M L G S A M S R P M L H F G N D W E D R Y Y R E N M Y R Y P N Q V Y Y R P V D Q Y S N Q N N F V H D C V N I T I K Q H T V T T T T K G E N F T E T D V K M M E R V V E Q M C V T Q Y Q K E S Q A Y Y D G R R S S - A V L F S S P P V I L L I S F L I F L I V G - 109 black rat Rattus rattus unpub.Sch07 - wt main pro >620_Rat.rat.....rod.mur.rat:: M A - - N L G Y W L L A L F V T T C T D V G L C K K R P K P G G - W N T G G S R Y P G Q G S P G G N R Y P G G G T H N Q W N K P S K P K T N L K H V A G A A A A G A V V G G L G G Y M L G S A M S R P M L H F G N D W E D R Y Y R E N M Y R Y P N Q V Y Y R P V D Q Y S N Q N N F V H D C V N I T I K Q H T V T T T T K G E N F T E T D V K M M E R V V E Q M C V T Q Y Q K E S Q A Y Y D G R R S S - A V L F S S P P V I L L I S F L I F L I V G - 36 gerbil Meriones unguiculatus unpub.Sch10 - wt main pro >625_Mer.ung.....rod.mur.ger:: M A - - N L G Y W L L A L F V T M W T D V G L C K K R P K P G G - W N T G G S R Y P G Q G S P G G N R Y P G G G T H S Q W N K P S K P K T N M K H V A G A A A A G A V V G G L G G Y M L G S A M S R P M I H F G N D W E D R Y Y R E N M Y R Y P N Q V Y Y R P V D Q Y S N Q N N F V H D C V N I T I K Q H T V T T T T K G E N F T E T D V K M M E R V V E Q M C V T Q Y Q K E S Q A Y Y D G R R S S - A V L F S S P P V I L L I S F L L F L I V G - 34 cotton rat Sigmodon fulviventer unpub.Sch08 has the ser wt main pro >630_Sig.ful.....rod.mur.cot:: M A - - N L G Y W L L A L F V A T W T D V G L C K K R P K P G G - W N T G G S R Y P G Q G N P G G N R Y P G G G T H S Q W N K P S K P K T N M K H V A G A A A A G A V V G G L G G Y M L G S A M S R P M I H F G N D W E D R Y Y R E N M Y R Y P N Q V Y Y R P V D Q Y N N Q N N F V H D C V N I T I K Q H T V T T T T K G E N F T E T D V K M M E R V V E Q M C V T Q Y Q K E S Q A Y Y D G R R S S - A V L F S S P P M I L L I S F L I F L I V G - 35 cotton rat Sigmodon hispiedis unpub.Sch09 - wt main pro >635_Sig.his.....rod.mur.cot:: M A - - N L G Y W L L A L F V A T W T D V G L C K K R P K P G G - W N T G G S R Y P G Q G N P G G N R Y P G G G T H S Q W N K P S K P K T N M K H V A G A A A A G A V V G G L G G Y M L G S A M S R P M I H F G N D W E D R Y Y R E N M Y R Y P N Q V Y Y R P V D Q Y N N Q N N F V H D C V N I T I K Q H T V T T T T K G E N F T E T D V K M M E R V V E Q M C V T Q Y Q K E S Q A Y Y D G R R S S - A V L F S S P P M I L L I S F L I F L I V G - 32 chinese hamster Cricetulus griseus M33958 A34759 wt main pro >640_Cri.gri.....rod.mur.ham:: M A - - N L S Y W L L A L F V A T W T D V G L C K K R P K P G G - W N T G G S R Y P G Q G S P G G N R Y P G G G T H N Q W N K P S K P K T N M K H V A G A A A A G A V V G G L G G Y M L G S A M S R P M L H F G N D W E D R Y Y R E N M N R Y P N Q V Y Y R P V D Q Y N N Q N N F V H D C V N I T I K Q H T V T T T T K G E N F T E T D V K M M E R V V E Q M C V T Q Y Q K E S Q A Y Y D G R R S S - A V L F S S P P V I L L I S F L I F L I V G - 33 armenian hamster Cricetulus migratorius M33959 - wt main pro >645_Cri.mig.....rod.mur.ham:: M A - - N L S Y W L L A L F V A T W T D V G L C K K R P K P G G - W N T G G S R Y P G Q G S P G G N R Y P G G G T H N Q W N K P N K P K T S M K H M A G A A A A G A V V G G L G G Y M L G S A M S R P M L H F G N D W E D R Y Y R E N M N R Y P N Q V Y Y R P V D Q Y N N Q N N F V H D C V N I T I K Q H T V T T T T K G E N F T E T D V K M M E R V V E Q M C V T Q Y Q K E S Q A Y Y D G R R S S - A V L F S S P P V I L L I S F L I F L I V G - 116 guinea pig Cavia porcellus AF139166 - wt main pro >647_Cav.por.....rod.gui.pig:: - - - - - - - - - - L V L F V A T W S D T G L C K K R P K P G G G W N T G G S R Y P G G G S Y N Q W N K P S K P K T N M K H M A G A A A A G A V V G G L G G Y M L G S A M S 30 rabbit Oryctolagus cuniculus U28334 - wt main pro >650_Ory.cun.....lag.rab.rab:: M A - - H L G Y W M L L L F V A T W S D V G L C K K R P K P G G G W N T G G S R Y P G Q S S P G G N R Y P G G - T H N Q W G K P S K P K T S M K H V A G A A A A G A V V G G L G G Y M L G S A M S R P L I H F G N D Y E D R Y Y R E N M Y R Y P N Q V Y Y R P V D Q Y S N Q N S F V H D C V N I T V K Q H T V T T T T K G E N F T E T D I K I M E R V V E Q M C I T Q Y Q Q E S Q A A Y Q R A A G - - V L L F S S P P V I L L I S F L I F L I V G - 120 rabbit Oryctolagus cuniculus AF015603 - allele 2 indels main pro >651_Ory.cun.....lag.rab.rab:: M A - - H L G Y W M L L L F V A T W S D V G L C K K R P K P G G G W N T G G S R Y P G Q S S P G G N R Y P G G G T H N Q W G K P S K P K T S M K H V A G A A A A G A V V G G L G G Y M L G S A M S R P L I H F G N D Y E D R Y Y R E N M Y R Y P N Q V Y Y R P V D Q Y S N Q N S F V H D C V N I T V K Q H T V T T T T K G E N F T E T D I K I M E R V V E Q M C I T Q Y Q Q E S Q A A Y Q R A A G - - V L L F S S P P V I L L I S F L I F L I V G - 900 bushy-tailed opossum Trichosurus vulpecular L38993 marsupial wt main pro >900_Tri.vul.....mar.......:: M G K I Q L G Y W I L V L F I V T W S D L G L C K K P K P R P G G G W N S G G S N R Y P G Q P G S P G G N R Y P G W G H - - G G Y N K W K P D K P K T N L K H V A G A A A A G A V V G G L G G Y M L G S A M S R P V I H F G N E Y E D R Y Y R E N Q Y R Y P N Q V M Y R P I D Q Y S S Q N N F V H D C V N I T V K Q H T T T T T T K G E N F T E T D I K I M E R V V E Q M C I T Q Y Q A E Y E A A A Q R A Y N M A F F S A P P V T L L F L S F L I F L I V S 965 chicken Gallus gallus M61145 Harris wt main pro >960_Gal.gal.....avi.neo.chi:: M A R L L T T C C L L A L L L A A C T D V A L S K K G K G K P S G G G W G A G S G Q G Y N P S S G G S Y H N Q K P W K P P K T N F K H V A G A A A A G A V V G G L G G Y A M G R V M S G M N Y H F D S P D E Y R W W S E N S A R Y P N R V Y Y R D Y S S P V P Q D V F V A D C F N I T V T E Y S I G P A A K K N T S E A V A A A N Q T E V E M E N K V V T K V I R E M C V Q Q Y R E Y R L A S G I Q L H P A D T W L A V L L L L L T T L F A M H 960 chicken Gallus gallus M9540 White Leghorn, Prusiner all:lon main pro >960_Gal.gal.lon.avi.neo.chi:: M A R L L T T C C L L A L L L A A C T D V A L S K K G K G K P S G G G W G A G S G Q G Y N P S S G G S Y H N Q K P W K P P K T N F K H V A G A A A A G A V V G G L G G Y A M G R V M S G M N Y H F D R P D E Y R W W S E N S A R Y P N R V Y Y R D Y S S P V P Q D V F V A D C F N I T V T E Y S I G P A A K K N T S E A V A A A N Q T E V E M E N K V V T K V I R E M C V Q Q Y R E Y R L A S G I Q L H P A D T W L A V L L L L L T T L F A M H 970 Antarctic prion Pachyptila desolata unpub.Sch93 - wt main pro >965_Pac.des.....avi.neo.pri:: - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - K K G K G K P S G G G W G T G S G Q G Y N P S S G G T Y H N Q K P W K P P K S K T N F K H V A G A A A A G A V V G G L G G Y A I G R V M S G M H Y R F D S P D E Y R W W N E N S A R Y P N Q V Y Y P D Y R S P V S Q D V F V A D C F N I T V T E Y N I G P A A K K N V S E A A P A A N Q T E T E L E T K V V T K V I R E M C I Q Q Y R E Y R L 975 fairy prion Pachyptila turtur unpub.Sch94 - wt main pro >970_Pac.tur.....avi.neo.pri:: - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - K K G K G K P S G G G W G T G S G Q G Y N P S S G G T Y H N Q K P W K P P K S K T N F K H V A G A A A A G A V V G G L G G Y A M G R V M S G M H Y R F D S P D E Y R W W N E N S A R Y P N Q V Y Y R D Y R S P V S Q D V F V A D C F N I T V T E Y N I G P A A K K N V S E A A P A A N Q T E T E L E T K V V T K V I R E M C I Q Q Y R E Y R L 980 crane Grus americana unpub.Sch95 - wt main pro >975_Gru.ame.....avi.neo.cra:: - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - K K G K G K P S G G G W G T G S S S G G S Y H N Q K P W K P P K S K T N L K H V A G A A A A G A V V G G L G G Y A M G R V M S G M H Y R F D S P D E Y R W W N E N S A R Y P N Q V Y Y R D Y S S P V S Q D V F V A D C F N I T V T E Y N I G P A A K K N V S E A G A A V N Q T E T E L E T K V V T K V I R E M C I Q Q Y R E Y R L 985 condor Vultur gryphus unpub.Sch96 - wt main pro >980_Vul.gry.....avi.neo.con:: - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - K K G K G K P S G G G W G T G S S S G G S Y H N Q K P W K P P K S K T N F K H V A G A A A A G A V V G G L G G Y A M G R V M S G M H Y R F D S P D E Y R W W N E N S A R Y P N Q V Y Y R D Y S S P V S Q D I F V A D C F N I T V T E Y N I G P A A K K N T S E A G L A V N Q T E T E L E T K V V T K V I R E M C I Q Q Y R E Y R L 990 ostrich Struthio camelus unpub.Sch97 - wt main pro >985_Str.cam.....avi.pal.ost:: - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - G Q G Y N P S S G G S Y H N Q K P W K P P K S K T N F K H V A G A A A A G A V V G G L G G Y V M G R A M S G M H Y H F D S P D E Y R W W N E N A G R Y P N R V Y Y R D Y S S P V T Q D M 995 mallard Anas platyrhynchos unpub.Sch98 - wt main pro >990_Ana.pla.....avi.neo.duc:: - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - K K G K G K P S G G G W G T G S G Y N P S S G G N Y H H Q K P W K P P K T N F K H V A G A A A A G A V V G G L G G Y A M G R V M S G M H Y H F D S P D E Y R W W N E N S A R Y P N R V Y Y R D Y G S T V S Q D V F V A D C F N I T V T E Y N I G P A A K K N G S E A G P G A N Q T E T E M E T K V V T K V I R E M C V Q Q Y R E Y R L 995 mallard Anas platyrhynchos unpub.Sch98 - wt main pro >990_Ana.pla.....avi.neo.duc:: cac cgc cag ccc agc tac ccc cgc cag cct ggc tac ccc cag aat cct ggt tat ccc cac aac ccg ggg tat ccc cac aac ccg ggg tac ccc cat aac cca ggg tac ccc cac aac ccc ggc tgg 999 barn owl Tyto alba unpub.Sch99 - wt main pro >995_Tyt.alb.....avi.rap.bar:: - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - K K G K G K P S G G G W G T G S G Q G Y N P S S G G S Y H N Q K P W K P P K S K T N F K H V A G A A A A G A V V G G L G G Y A M G R V M S G M H Y R F D S P D E Y Q W W N E N S A R Y P N R V Y Y R D Y S S P V T Q D V F V A D C F N I T V T E Y N I G P A A K K N T S E A G P A V N Q T E M E M E T K V V T K V I R E M C V Q Q Y R E Y R L 1001 mouse Mus musculus U29187 doppel main pro doppel M K N R L G T W W V A I L C M L L A S H L S T V K A R G I K H R F K W N R K V L P S S G G Q I T E A R V A E N R P G A F I K Q G R K L D I D F G A E G N R Y Y A A N Y W Q F P D G I Y Y E G C S E A N V T K E M L V T S C V N A T Q A A N Q A E F S R E K Q D S K L H Q R V L W R L I K E I C S A K H C D F W L E R G A A L R V A V D Q P A M V C L L G F V W F I V K - 1002 rat Rattus rattus JMB 99 doppel main pro doppel M K N R L G T W G L A I L C L L L A S H L S T V K A R G I K H R F K W N R K V L P S S G - Q I T E A Q V A E N R P G A F I K Q G R K L D I D F G A E G N K Y Y A A N Y W Q F P D G I Y Y E G C S E A N V T K E V L V T R C V N A T Q A A N Q A E F S R E K Q D S K L H Q R V L W R L I K E I C S T K H C D F W L E R G A A L R I T V D Q Q A M V C L L G F I W F I V K 1003 human Homo sapiens AF106918 doppel M174 allele main pro doppel M R K H L S W W W L A T V C M L L F S H L S A V Q T R G I K H R I K W N R K A L P S T A - Q I T E A Q V A E N R P G A F I K Q G R K L D I D F G A E G N R Y Y E A N Y W Q F P D G I H Y N G C S E A N V T K E A F V T G C I N A T Q A A N Q G E F - - Q K P D N K L H Q Q V L W R L V Q E L C S L K H C E F W L E R G A G L R V T M H Q P V L L C L L A L I W L M V K - 1004 human Homo sapiens AL133396 doppel T174 allele main pro doppel M R K H L S W W W L A T V C M L L F S H L S A V Q T R G I K H R I K W N R K A L P S T A - Q I T E A Q V A E N R P G A F I K Q G R K L D I D F G A E G N R Y Y E A N Y W Q F P D G I H Y N G C S E A N V T K E A F V T G C I N A T Q A A N Q G E F - - Q K P D N K L H Q Q V L W R L V Q E L C S L K H C E F W L E R G A G L R V T M H Q P V L L C L L A L I W L T V K - 70 pronghorn Antilocapra americana F090852 - wt rep 6n pro >100_Ant.ame.lon.fer.rum.bov:: P Q G G G G W G Q P H G G G W G Q P H G G G W G Q P H G G G W G Q P H G G G W G Q P H G G G G W G Q 104 wisent Bison bonasus unpub.Sch01 long subset of S55629 wt rep 6n pro >110_Bis.bon.lon.fer.rum.bov:: P Q G G G G W G Q P H G G G W G Q P H G G G W G Q P H G G G W G Q P H G G G W G Q P H G G G G W G Q 72 banteng Bos javanicus unpub.Sch13 short wt rep 5n pro >115_Bos.jav.sho.fer.rum.bov:: P Q G G G G W G Q P H G G G W G Q P H G G G W G Q - - - - - - - - P H G G G W G Q P H G G G G W G Q 91 watussi Bos primigenius taurus unpub.Sch03 long 6 repeats wt rep 6n pro >120_Bos.pri.lon.fer.rum.bov:: P Q G G G G W G Q P H G G G W G Q P H G G G W G Q P H G G G W G Q P H G G G W G Q P H G G G G W G Q 54 cow Bos taurus D10614 short D90547 771bp wt rep 5n pro >125_Bos.tau.sho.fer.rum.bov:: P Q G G G G W G Q P H G G G W G Q P H G G G W G Q - - - - - - - - P H G G G W G Q P H G G G G W G Q 55 cow Bos taurus S55629 long 6 repeats all:long rep 6n pro >130_Bos.tau.lon.fer.rum.bov:: P Q G G G G W G Q P H G G G W G Q P H G G G W G Q P H G G G W G Q P H G G G W G Q P H G G G G W G Q 58 cow Bos taurus AB001468 long 6 repeats all:long rep 6n pro >145_Bos.tau.lon.fer.rum.bov:: P Q G G G G W G Q P H G G G W G Q P H G G G W G Q P H G G G W G Q P H G G G W G Q P H G G G G W G Q 119 cow Bos taurus AJ132392 long 7 repeats all:long 7 rep 7n pro >147_Bos.tau.lon.fer.rum.bov:: P Q G G G G W G Q P H G G G W G Q P H G G G W G Q P H G G G W G Q P H G G G W G Q P H G G G W G Q P H G G G G W G Q 87 nyala Tragelaphus angasi unpub.Sch24 - wt rep 5n pro >155_Tra.ang.....fer.rum.bov:: S Q G G G G W G Q P H G G G W G Q P H G G G W G Q - - - - - - - - P H G G G W G Q P H G G G G W G Q 60 greater kudu Tragelaphus strepsiceros X74759 C extra P40243 X74759 X74771 bad Martin has initial proline in A rep1 all:long rep 6n pro >160_Tra.str.lon.fer.rum.bov:: S Q G G G G W G Q P H G G G W G Q P H G G G W G Q P H G G G W G Q P H G G G W G Q P H G G G G W G Q 111 greater kudu Tragelaphus strepsiceros unsub.Poi B Poidinger M Arch Virol 131: 193-199 (1993) wt rep 5n pro >161_Tra.str.sho.fer.rum.bov:: S Q G G G G W G Q P H G G G W G Q P H G G G W G Q - - - - - - - - P H G G G W G Q P H G G G G W G Q - 50 african goat Capris hircus S82626 - wt rep 5n pro >167_Cap.hir.....fer.rum.ovi:: P Q G G G G W G Q P H G G G W G Q P H G G G W G Q - - - - - - - - P H G G G W G Q P H G G G G W G Q 53 goat Capris hircus unpub.Sch11 - all:212 RQ rep 5n pro >180_Cap.hir.....fer.rum.ovi:: P Q G G G G W G Q P H G G G W G Q P H G G G W G Q - - - - - - - - P H G G G W G Q P H G G G G W G Q 105 nubian ibex Capra ibex nubiana unpub.Sch02 - wt rep 5n pro >185_Cap.ibe.....fer.rum.ovi:: P Q G G G G W G Q P H G G G W G Q P H G G G W G Q - - - - - - - - P H G G G W G Q P H G G G G W G Q 108 muskox Ovibos moschatus moschatus unpub.Sch06 - wt rep 5n pro >190_Ovi.mos.....fer.rum.ovi:: P Q G G G G W G Q P H G G G W G Q P H G G G W G Q - - - - - - - - P H G G G W G Q P H G G G G W G Q 43 sheep Ovis aries AJ000738 VQ all:136 AV rep 5n pro >195_Ovi.ari.....fer.rum.ovi:: P Q G G G G W G Q P H G G G W G Q P H G G G W G Q - - - - - - - - P H G G G W G Q P H G G G G W G Q 45 sheep Ovis aries AJ000736 AR all:171 QR rep 5n pro >200_Ovi.ari.....fer.rum.ovi:: P Q G G G G W G Q P H G G G W G Q P H G G G W G Q - - - - - - - - P H G G G W G Q P H G G G G W G Q 46 sheep Ovis aries AJ000734 AH all:171 QH rep 5n pro >205_Ovi.ari.....fer.rum.ovi:: P Q G G G G W G Q P H G G G W G Q P H G G G W G Q - - - - - - - - P H G G G W G Q P H G G G G W G Q 48 sheep Ovis aries AJ000680 AF141Q all:141 LF rep 5n pro >210_Ovi.ari.....fer.rum.ovi:: P Q G G G G W G Q P H G G G W G Q P H G G G W G Q - - - - - - - - P H G G G W G Q P H G G G G W G Q 44 sheep Ovis aries AJ000737 AH154Q all:154 RH rep 5n pro >215_Ovi.ari.....fer.rum.ovi:: P Q G G G G W G Q P H G G G W G Q P H G G G W G Q - - - - - - - - P H G G G W G Q P H G G G G W G Q 47 sheep Ovis aries AJ000681 AQQ211 all:211 RQ rep 5n pro >220_Ovi.ari.....fer.rum.ovi:: P Q G G G G W G Q P H G G G W G Q P H G G G W G Q - - - - - - - - P H G G G W G Q P H G G G G W G Q 41 sheep Ovis aries AJ000735 T112AQ all:112 MT rep 5n pro >225_Ovi.ari.....fer.rum.ovi:: P Q G G G G W G Q P H G G G W G Q P H G G G W G Q - - - - - - - - P H G G G W G Q P H G G G G W G Q 49 sheep Ovis aries AJ000679 AT137Q all:137 MT rep 5n pro >230_Ovi.ari.....fer.rum.ovi:: P Q G G G G W G Q P H G G G W G Q P H G G G W G Q - - - - - - - - P H G G G W G Q P H G G G G W G Q 42 sheep Ovis aries AJ000739 AQ P23907? wt rep 5n pro >235_Ovi.ari.....fer.rum.ovi:: P Q G G G G W G Q P H G G G W G Q P H G G G W G Q - - - - - - - - P H G G G W G Q P H G G G G W G Q 117 bighorn sheep Ovis canadensis AF166334 - wt rep 5n pro >236_Ovi.can.....fer.rum.ovi:: P Q G G G G W G Q P H G G G W G Q P H G G G W G Q - - - - - - - - P H G G G W G Q P H G G G G W G Q 68 elk Cervus elaphus nelsoni AF016228 - all:129 ML rep 5n pro >245_Cer.ela.nel.fer.rum.cer:: P Q G G G G W G Q P H G G G W G Q P H G G G W G Q - - - - - - - - P H G G G W G Q P H G G G G W G Q 100 elk Cervus elaphus nelsoni U21210 Cervenakova wt rep 5n pro >250_Cer.ela.nel.fer.rum.cer:: P Q G G G G W G Q P H G G G W G Q P H G G G W G Q - - - - - - - - P H G G G W G Q P H G G G G W G Q 82 dybowsky deer Cervus nippon dybowskii AF113941 - wt rep 5n pro >255_Cer.nip.dyb.fer.rum.cer:: P Q G G G G W G Q P H G G G W G Q P H G G G W G Q - - - - - - - - P H G G G W G Q P H G G G G W G Q 62 red deer Cervus elaphus Y09761 - wt rep 5n pro >260_Cer.ela.....fer.rum.cer:: P Q G G G G W G Q P H G G G W G Q P H G G G W G Q - - - - - - - - P H G G G W G Q P H G G G G W G Q 107 muntjak Muntiacus muntjak AF113944 - wt rep 5n pro >270_Mun.mun.....fer.rum.cer:: P Q G G G G W G Q P H G G G W G Q P H G G G W G Q - - - - - - - - P H G G G W G Q P H G G G G W G Q 65 mule deer Odocoileus hemionus hemionus AF009180 Allele S2 O'Rourke all:silent rep 5n pro >275_Odo.hem.hem.fer.rum.cer:: P Q G G G G W G Q P H G G G W G Q P H G G G W G Q - - - - - - - - P H G G G W G Q P H G G G G W G Q 66 mule deer Odocoileus hemionus hemionus AF009181 Allele S1 O'Rourke wt rep 5n pro >280_Odo.hem.hem.fer.rum.cer:: P Q G G G G W G Q P H G G G W G Q P H G G G W G Q - - - - - - - - P H G G G W G Q P H G G G G W G Q 63 mule deer Odocoileus hemionus hemionus U25965 U97331 P47852 O'Rourke 3 alleles N1 all:138 SN rep 5n pro >281_Odo.hem.hem.fer.rum.cer:: P Q G G G G W G Q P H G G G W G Q P H G G G W G Q - - - - - - - - P H G G G W G Q P H G G G G W G Q 113 white-tailed deer Odocoileus virginianus AF091558 O'Rourke allele 96G-132M-138S wt rep 5n pro >285_Odo.vir....fer.rum.cer:: P Q G G G G W G Q P H G G G W G Q P H G G G W G Q - 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wt rep 5n pro >310_Bud.tax.....fer.rum.mis:: P Q G G G G W G Q P H G G G W G Q P H G G G W G Q - - - - - - - - P H G G G W G Q P H G G G G W G Q 71 addax antelope Addax nasomaculatus unpub.Sch12 - wt rep 5n pro >315_Add.nas.....fer.rum.mis:: P Q G G G G W G Q P H G G G W G Q P H G G G W G Q - - - - - - - - P H G G G W G Q P H G G G G W G Q 88 sable antelope Hippotragus niger unpub.Sch25 - wt rep 5n pro >320_Hip.nig.....fer.rum.mis:: P Q G G G G W G Q P H G G G W G Q P H G G G W G Q - - - - - - - - P H G G G W G Q P H G G G G W G Q 110 arabian oryx Oryx leucoryx unsub.Poi Poidinger M Arch Virol 131 (1-2): 193-199 (1993): not submitted genbank wt rep 5n pro >325_Ory.leu.....fer.rum.mis:: S Q G G G G W G Q P H G G G W G Q P H G G G W G Q - - - - - - - - P H G G G W G Q P H G G G G W G Q 80 bottle-nosed dolphin Tursiops truncatus unpub.Sch17 - wt rep 6n pro >330_Tur.tru.....fer.cet.dol:: P Q G G G G W G Q P H G G G W G Q P H G G G W G Q - - - - - - - - P H G G G W G Q P H G G G G W G Q 102 pig Sus scrofa L07623 P49927 wt rep 5n pro >335_Sus.scr.....fer.cam.sus:: P Q G G G G W G Q P H G G G W G Q P H G G G W G Q - - - - - - - - P H G G G W G Q P H G G G G W G Q 69 camel Camelus dromedarius Y09760 - wt rep 5 pro >340_Cam.dro.....fer.cam.cam:: P Q G G G G W G Q P H G G G W G Q P H G G G W G Q - - - - - - - - P H G G G W G Q P H G G G - W G Q 81 camel Camelus dromedarius AF113940 - all:209 delM rep 5 pro >345_Cam.dro.....fer.cam.cam:: P Q G G G G W G Q P H G G G W G Q P H G G G W G Q - - - - - - - - P H G G G W G Q P H G G G - W G Q 85 llama Lama glama AF113943 - wt rep 6 pro >350_Lam.gla.....fer.cam.lam:: P Q G G G G W G Q P H G G G W G Q P H G G G W G Q P H G G G W G Q P H G G G W G Q P H G G G - W G Q 79 horse Equus familiaris caballus unpub.Sch16 - wt rep 5n pro >360_Equ.fam.cab.fer.per.hor:: P Q G G G G W G Q P H G G G W G Q P H G G G W G Q - - - - - - - - P H G G G W G Q P H G G G G W G Q 106 zebra Equus quagga boehmi unpub.Sch04 - wt rep 5n pro >365_Equ.qua.boe.fer.per.hor:: P Q G G G G W G Q P H G G G W G Q P H G G G W G Q - - - - - - - - P H G G G W G Q P H G G G G W G Q 77 canadian wolf Canis lupus canadensis AF113939 - wt rep 5n pro >370_Can.lup.fam.fer.car.dog:: P Q G G G G W G Q P H G G G W G Q P H G G G W G Q - - - - - - - - P H G G G W G Q P H G G G G W G Q 76 dog Canis lupus familiaris AF042843 - wt rep 5n pro >375_Can.lup.fam.fer.car.dog:: P Q G G G G W G Q P H G G G W G Q P H G G G W G Q - - - - - - - - P H G G G W G Q P H G G G G W G Q 112 dog (greyhound) Canis lupus familiaris AF113938 - wt rep 5n pro >381_Can.lup.fam.fer.car.dog:: P Q G G G G W G Q P H G G G W G Q P H G G G W G Q - - - - - - - - P H G G G W G Q P H G G G G W G Q 78 dingo Canis lupus hallstromii AF113937 - wt rep 5n pro >385_Can.lup.hal.fer.car.dog:: P Q G G G G W G Q P H G G G W G Q P H G G G W G Q - - - - - - - - P H G G G W G Q P H G G G G W G Q 74 cat Felis catus Y13698 - wt rep 5n pro >390_Fel.cat.....fer.car.cat:: - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 75 cat Felis catus AF003087 - wt rep 5n pro >395_Fel.cat.....fer.car.cat:: P Q G G G G W G Q P H G G G W G Q P H G G G W G Q - - - - - - - - P H G G G W G Q P H G G G G W G Q 103 polecat Mustela putorius U08952 P52114 wt rep 5n pro >400_Mus.put.....fer.car.mnk:: P Q G G G G W G Q P H G G G W G Q P H G G G W G Q - - - - - - - - P H G G G W G Q P H G G G G W G Q 73 mink Mustela vison S46825 P40244 wt rep 5n pro >410_Mus.vis.....fer.car.mnk:: P Q G G G G W G Q P H G G G W G Q P H G G G W G Q - - - - - - - - P H G G G W G Q P H G G G G W G Q 10 night monkey Aotus trivirgatus U08293 P40245 wt rep 5 pro >415_Aot.tri.....pri.nwm.mon:: P Q S G G - W G Q P H G G G W G Q P H G G G W G Q - - - - - - - - P H G G G W G Q P H G G G - W G Q 24 black-handed spider monkey Ateles geoffroyi U08309 P40246 wt rep 4 pro >420_Ate.geo.....pri.nwm.mon:: P Q G G G - W G Q P H G G G W G Q P H G G G W G Q - - - - - - - - - - - - - - - - P H G G G - W G Q 25 black spider x b-h spider Ateles paniscus x Ateles fusciceps U15164 P51446 wt rep 5 pro >425_Ate.pan.....pri.nwm.mon:: P Q G G G - W G Q P H G G G W G Q P H G G G W G Q - - - - - - - - P H G G G W G Q P H G G G - W G Q 27 marmoset Callithrix jacchus U08304 P40247 wt rep 5 pro >430_Cal.jac.....pri.nwm.mon:: P Q G G G - W G Q P H G G G W G Q P H G G G W G Q - - - - - - - - P H G G G W G Q P H G G G - W G Q 26 brown-capped capuchin Cebus apella U08295 P40249 wt rep 5 pro >435_Ceb.ape.....pri.nwm.mon:: P Q G G G - W G Q P H G G G W G Q P H G G G W G Q - - - - - - - - P H G G S W G Q P H G G G - W G Q 28 squirrel monkey Saimiri sciureus U08310 P40258 all:long rep 6 pro >440_Sai.sci.lon.pri.nwm.mon:: P Q G G G - W G Q P H G G G W G Q P H G G G W G Q P H G G G W G Q P H G G G W G Q P H G G G - W G Q 29 squirrel monkey Saimiri sciureus U15165 - wt rep 5 pro >445_Sai.sci.....pri.nwm.mon:: P Q G G G - W G Q P H G G G W G Q P H G G G W G Q - - - - - - - - P H G G G W G Q P H G G G - W G Q 16 gelada baboon Theropithecus gelada U75383 TGU75383 U75383 g1658480 wt rep 4 pro >450_The.gel.....pri.owm.mon:: P Q G G G G W G Q P H G G G W G Q P H G G G W G Q - - - - - - - - - - - - - - - - P H G G G - W G Q 93 dusky titi Callicebus moloch U08312 P40248 wt rep 5 pro >455_Cal.mol.....pri.owm.mon:: P Q G G G S W G Q P H G G G W G Q P H G G G W G Q - - - - - - - - P H G G G W G Q P H G G G - W G Q 1 green monkey or grivet Cercopithecus aethiops U08291 P40250 wt rep 4 pro >460_Cer.aet.....pri.owm.mon:: P Q G G G G W G Q P H G G G W G Q P H G G G W G Q - - - - - - - - - - - - - - - - P H G G G - W G Q 3 mangabey Cercocebus aterrimus U75384 van der Kuyl g1658467 CAU75384 U75384 g1658466 wt rep 4 pro >465_Cer.ate.....pri.owm.mon:: P Q G G G G W G Q P H G G G W G Q P H G G G W G Q - - - - - - - - - - - - - - - - P H G G G - W G Q 98 diana monkey Cercopithecus dianae U08292 - wt rep 4 pro >470_Cer.dia.....pri.owm.bab:: P Q G G G G W G Q P H G G G W G Q P H G G G W G Q - - - - - - - - - - - - - - - - P H G G G - W G Q 4 baboon Cercopithecus mona U75386 van der Kuyl g1658471 CMU75386 U75386 g1658470 wt rep 5 pro >475_Cer.mon.....pri.owm.bab:: P Q G G G G W G Q P H G G G W G Q P H G G G W G Q - - - - - - - - P H G G G W G Q P H G G G - W G Q 5 neglected monkey Cercopithecus neglectus U75387 van der Kuyl g1658473 CNU75387 U75387 g1658472 wt rep 5 pro >480_Cer.neg.....pri.owm.bab:: P Q G G G G W G Q P H G G G W G Q P H G G G W G Q - - - - - - - - P H G G G W G Q P H G G G - W G Q 6 patas monkey Cercopithecus patas U75388 van der Kuyl g1658475 CPU75388 U75388 g1658474 wt rep 5 pro >485_Cer.pat.....pri.owm.bab:: P Q G G G G W G Q P H G G G W G Q P H G G G W G Q - - - - - - - - P H G G G W G Q P H G G G - W G Q 14 sooty mangabey Cercocebus torquatus atys U75385 g1658477 wt rep 5 pro >490_Cer.tor.....pri.owm.mon:: P Q G G G G W G Q P H G G G W G Q P H G G G W G Q - - - - - - - - P H G G G W G Q P H G G G - W G Q 7 colubus Colobus guereza U08297 P40251 wt rep 5 pro >495_Col.gue.....pri.owm.mon:: P Q G G G G W G Q P H G G G W G Q P H G G G W G Q - - - - - - - - P H G G G W G Q P H G G G - W G Q 15 stump-tailed macaque Macaca arctoides U08311 - wt rep 5 pro >505_Mac.arc.....pri.owm.mac:: P Q G G G G W G Q P H G G G W G Q P H G G G W G Q - - - - - - - - P H G G G W G Q P H G G G - W G Q 9 crab-eating macaque Macaca fascicularis U08298 P40254 wt rep 5 pro >510_Mac.fas.....pri.owm.mac:: P Q G G G G W G Q P H G G G W G Q P H G G G W G Q - - - - - - - - P H G G G W G Q P H G G G - W G Q 97 japanese macaque Macaca fuscata U08301 - wt rep 5 pro >515_Mac.fus.....pri.owm.mac:: P Q G G G G W G Q P H G G G W G Q P H G G G W G Q - - - - - - - - P H G G G W G Q P H G G G - W G Q 99 rhesus macaque Macaca mulatta U15163 Cervenakova wt rep 5 pro >525_Mac.mul.....pri.owm.mac:: P Q G G G G W G Q P H G G G W G Q P H G G G W G Q - - - - - - - - P H G G G W G Q P H G G G - W G Q 96 pig-tailed macaque Macaca nemestrina U08306 - wt rep 5 pro >530_Mac.nem.....pri.owm.mac:: P Q G G G G W G Q P H G G G W G Q P H G G G W G Q - - - - - - - - P H G G G W G Q P H G G G - W G Q 2 barbary macaque Macaca sylvanus U75382 van der Kuyl g1658479 wt rep 4 pro >535_Mac.syl.....pri.owm.mac:: P Q G G G G W G Q P H G G G W G Q P H G G G W G Q - - - - - - - - - - - - - - - - P H G G G - W G Q 11 mandrill Mandrillus sphinx U08303 P40255 wt rep 5 pro >540_Man.sph.....pri.owm.mon:: P Q G G G G W G Q P H G G G W G Q P H G G G W G Q - - - - - - - - P H G G G W G Q P H G G G - W G Q 12 hamadryas baboon Papio hamadryas U08294 - wt rep 5 pro >545_Pap.ham.....pri.owm.mon:: P Q G G G G W G Q P H G G G W G Q P H G G G W G Q - - - - - - - - P H G G G W G Q P H G G G - W G Q 13 langur Presbytis francoisi U08302 P40257 wt rep 5 pro >550_Pre.fra.....pri.owm.mon:: P Q G G G G W G Q P H G G G W G Q P H G G G W G Q - - - - - - - - P H G G G W G Q P H G G G - W G Q 118 lemur Varecia variegata variegata AF177293 - wt rep 3 pro >553_Var.var.....pri.owa.lem:: P Q G G G - W G Q P H G G G W G Q P H G G G W G Q - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 18 gorilla Gorilla gorilla U08300 P40252 wt rep 5 pro >555_Gor.gor.....pri.owa.ape:: P Q G G G G W G Q P H G G G W G Q P H G G G W G Q - - - - - - - - P H G G G W G Q P H G G G - W G Q 19 gorilla Gorilla gorilla U15166 - all:6 CY rep 5 pro >560_Gor.gor.....pri.owa.ape:: P Q G G G G W G Q P H G G G W G Q P H G G G W G Q - - - - - - - - P H G G G W G Q P H G G G - W G Q 21 human Homo sapiens M13899 - wt rep 5 pro >565_Hom.sap.....pri.owa.ape:: P Q G G G G W G Q P H G G G W G Q P H G G G W G Q - - - - - - - - P H G G G W G Q P H G G G - W G Q 999 human Homo sapiens M13899 - all:22 rep 4 pro >566_Hom.sap.....pri.owa.ape:: P Q G G G G W G Q P H G G G W G Q P H G G G W G Q - - - - - - - - - - - - - - - - P H G G G - W G Q 17 malayan gibbon Hylobates lar U08299 - wt rep 5 pro >570_Hya.lar.....pri.owa.ape:: P Q G G G G W G Q P H G G G W G Q P H G G G W G Q - - - - - - - - P H G G G W G Q P H G G G - W G Q 20 chimpanzee Pan troglodytes U08296 P40253 wt rep 5 pro >575_Pan.tro.....pri.owa.ape:: P Q G G G G W G Q P H G G G W G Q P H G G G W G Q - - - - - - - - P H G G G W G Q P H G G G - W G Q 22 orangutan Pongo pygmaeus U08305 P40256 wt rep 5 pro >585_Pon.pyg.....pri.owa.ape:: P Q G G G G W G Q P H G G G W G Q P H G G G W G Q - - - - - - - - P H G G G W G Q P H G G G - W G Q 94 siamang Symphalangus syndactylus U08308 Hylobates syndactylus? wt rep 5 pro >590_Sym.syn.....pri.owa.ape:: P Q G G G G W G Q P H G G G W G Q P H G G G W G Q - - - - - - - - P H G G G W G Q P H G G G - W G Q 31 golden syrian hamster Mesocricetus auratus U78769 P04273 wt rep 5 pro >600_Mes.aur.....rod.mur.ham:: P Q G G G T W G Q P H G G G W G Q P H G G G W G Q - - - - - - - - P H G G G W G Q P H G G G - W G Q 39 mouse Mus musculus M18071 long P04925 all:108LF+189TV rep 5 pro >600_Mus.mus.lon.rod.mur.mus:: P Q G G - T W G Q P H G G G W G Q P H G G S W G Q - - - - - - - - P H G G S W G Q P H G G G - W G Q 37 mouse Mus musculus M18070 short PRIO_MOUSE P04925 DC2236E3CRC32 wt rep 5 pro >605_Mus.mus.sho.rod.mur.mus:: P Q G G - T W G Q P H G G G W G Q P H G G S W G Q - - - - - - - - P H G G S W G Q P H G G G - W G Q 38 mouse Mus musculus M13685 M136V 1986 strain all:136 MV rep 5 pro >610_Mus.mus.mtv.rod.mur.mus:: P Q G G - T W G Q P H G G G W G Q P H G G S W G Q - - - - - - - - P H G G S W G Q P H G G G - W G Q 40 rat Rattus norvegicus D50093 P13852 D50092S2 A53892 ? wt rep 5 pro >615_Rat.nor.....rod.mur.rat:: P Q S G G T W G Q P H G G G W G Q P H G G G W G Q - - - - - - - - P H G G G W G Q P H G G G - W S Q 109 black rat Rattus rattus unpub.Sch07 - wt rep 5 pro >620_Rat.rat.....rod.mur.rat:: P Q S G G T W G Q P H G G G W G Q P H G G G W G Q - - - - - - - - P H G G G W G Q P H G G G - W S Q 36 gerbil Meriones unguiculatus unpub.Sch10 - wt rep 5 pro >625_Mer.ung.....rod.mur.ger:: P Q G G G - W G Q P H G G G W G Q P H G G G W G Q - - - - - - - - P H G G G W G Q P H G G G - W G Q 34 cotton rat Sigmodon fulviventer unpub.Sch08 has the ser wt rep 5 pro >630_Sig.ful.....rod.mur.cot:: P Q G G G T W G Q P H G G G W G Q P H G G G W G Q - - - - - - - - P H G G G W G Q P H G G S - W G Q 35 cotton rat Sigmodon hispiedis unpub.Sch09 - wt rep 5 pro >635_Sig.his.....rod.mur.cot:: P Q G G G T W G Q P H G G G W G Q P H G G G W G Q - - - - - - - - P H G G G W G Q P H G G G - W G Q 32 chinese hamster Cricetulus griseus M33958 A34759 wt rep 5 pro >640_Cri.gri.....rod.mur.ham:: P Q G G G T W G Q P H G G G W G Q P H G G G W G Q - - - - - - - - P H G G G W G Q P H G G G - W G Q 33 armenian hamster Cricetulus migratorius M33959 - wt rep 5 pro >645_Cri.mig.....rod.mur.ham:: P Q G G G T W G Q P H G G G W G Q P H G G G W G Q - - - - - - - - P H G G G W G Q P H G G G - W G Q 116 guinea pig Cavia porcellus D50093 - wt rep 5 pro >647_Cav.por.....rod.gui.pig:: S H S G G T W G Q P H G G S W G Q P H G G G W G Q - - - - - - - - P H G G S W G Q P H G G G - W G H 30 rabbit Oryctolagus cuniculus U28334 - wt rep 5 pro >650_Ory.cun.....lag.rab.rab:: P Q G G G - W G Q P H G G G W G Q P H G G G W G Q - - - - - - - - P H G G G W G Q P H G G G - W G Q 120 rabbit Oryctolagus cuniculus AF015603 - allele 2 indels rep 5 pro >651_Ory.cun.....lag.rab.rab:: P Q G G G G W G Q P H G G G W G Q P H G G G W G Q - - - - - - - - P H G G G W G Q P H G G G - W G Q 900 bushy-tailed opossum Trichosurus vulpecular L38993 marsupial wt rep 4 pro >900_Tri.vul.....mar.......:: P Q G G G T N W G Q P H P G G S N W G Q P H P G G S S W G Q P H G G S N W G Q 965 chicken Gallus gallus M61145 Harris wt rep 8.5 pro >960_Gal.gal.....avi.neo.chi:: H R Q P S Y P R Q P G Y P H N P G Y P H N P G Y P H N P G Y P H N P G Y P H N P G Y P Q N P G Y P H N P G Y P G W 960 chicken Gallus gallus M9540 White Leghorn, Prusiner all:lon rep 9.5 pro >960_Gal.gal.lon.avi.neo.chi:: H R Q P S Y P R Q P G Y P H N P G Y P H N P G Y P H N P G Y P H N P G Y P Q N P G Y P H N P G Y P G W 970 Antarctic prion Pachyptila desolata unpub.Sch93 - wt rep 8 pro >965_Pac.des.....avi.neo.pri:: H R Q P S Y P R Q P G Y P Q N P G Y P H N P G Y P H N P G Y P H N P G Y P H N P G Y P Q N P G W 975 fairy prion Pachyptila turtur unpub.Sch94 - wt rep 8 pro >970_Pac.tur.....avi.neo.pri:: H R Q P S Y P R Q P G Y P Q N P G Y P H N P G Y P H N P G Y P H N P G Y P H N P G Y P Q N P G W 980 crane Grus americana unpub.Sch95 - wt rep 7 pro >975_Gru.ame.....avi.neo.cra:: H R Q P S Y P R Q P G Y P Q N P G Y P H N P G Y P H N P G Y P H N P G Y P H N P G W G Q G Y N P 985 condor Vultur gryphus unpub.Sch96 - wt rep 7 pro >980_Vul.gry.....avi.neo.con:: H R Q P S Y P R Q P S Y P Q N P G Y P H N P G Y P H N P G Y P H N P G Y P H N P G W G Q G Y N P 990 ostrich Struthio camelus unpub.Sch97 - wt rep 8 pro >985_Str.cam.....avi.pal.ost:: H N P G Y P H N P G Y P H N P G Y P H N P G Y P H N P G W 999 barn owl Tyto alba unpub.Sch99 - wt rep 8 pro >995_Tyt.alb.....avi.neo.bar:: H R Q P S Y P R Q P G Y P Q N P S Y P H N P G Y P H N P G Y P H N P G Y P H N P G Y P H N P G W 70 pronghorn Antilocapra americana F090852 - wt main dna >100_Ant.ame.lon.fer.rum.bov:: - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - tgc aag aag cga cca aaa cct gga gga gga tgg aac act ggg ggg agc cga tac cca gga cag ggc agt cct gga ggc aac cgc tat cca ggt ggc - acc cac agt cag tgg aac aag ccc agt aag cca aaa acc aac atg aag cat gtg gca gga gct gct gca gct gga gca gtg gta ggg ggc ctc ggt ggc tac atg ctg gga agt gcc atg agc agg cct ctt ata cat ttt ggc aat gac tat gag gac cgt tac tat cgt gaa aac atg tac cgt tac ccc aac caa gtg tac tac agg cca gtg gat cag tat agt aac cag aac acc ttt gtg cat gac tgt gtc aac atc aca gtc aag caa cac acg gtc acc acc acc acc aag ggg gag aac ttc acc gaa act gac atc aag atg atg gag cga gtg gtg gag caa atg tgc atc acc cag tac cag aga gaa tcc cag - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 104 wisent Bison bonasus unpub.Sch01 long subset of S55629 wt main dna >110_Bis.bon.lon.fer.rum.bov:: - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - .ga cag ggc agt cct gga ggc aac cgt tat cca ggt ggt - acc cac ggt caa tgg aac aaa ccc agt aag cca aaa acc aac atg aag cat gtg gca gga gct gct gca gct gga gca gtg gta ggg ggc ctt ggt ggc tac atg ctg gga agt gcc atg agc agg cct ctt ata cat ttt ggc agt gac tat gag gac cgt tac tat cgt gaa aac atg cac cgt tac ccc aac caa gtg tac tac agg cca gtg gat cag tat agt aac cag aac aac ttt gtg cat gac tgt gtc aac atc aca gtc aag gaa cac aca gtc acc acc acc acc aag ggg gag aac ttc acc gaa act gac atc aag atg atg gag cga gtg gtg gag caa atg tgc att acc cag tac cag aga gaa tcc cag gct tat tac caa cga ggg gca agt - - gtg - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 72 banteng Bos javanicus unpub.Sch13 short wt main dna >115_Bos.jav.sho.fer.rum.bov:: - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - cca aaa cct gga gga gga tgg aac acg ggg ggg agc cga tac cca gga cag ggc agt cct gga ggc aac cgt tat cca ggt ggt - acc cac ggt caa tgg aac aaa ccc agt aag cca aaa acc aac atg aag cat gtg gca gga gct gct gca gct gga gca gtg gta ggg ggc ctt ggt ggc tac atg ctg gga agt gcc atg agc agg cct ctt ata cat ttt ggc agt gac tat gag gac cgt tac tat cgt gaa aac atg cac cgt tac ccc aac caa gtg tac tac agg cca gtg gat cag tat agt aac cag aac agt ttt gtg cat gac tgt gtc aac atc aca gtc aag gaa cac aca gtc acc acc acc acc aag ggg gag aac ttc acc gaa act gac atc aag atg atg gag cga gtg gtg gag caa atg tgc att acc cag tac cag aga gaa tcc cag gct tat tac caa cga ggg gca agt - - gtg atc ctc ttc tct tcc cct cc. - - - - - - - - - - - - - - - 91 watussi Bos primigenius taurus unpub.Sch03 long 6 repeats wt main dna >120_Bos.pri.lon.fer.rum.bov:: - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - gga cag ggc att cct gga ggc aac cgt tat cca ggt ggt - acc cac ggt caa tgg aac aaa ccc agt aag cca aaa acc aac atg aag cat gtg gca gga gct gct gca gct gga gca gtg gta ggg ggc ctt ggt ggc tac atg ctg gga agt gcc atg agc agg cct ctt ata cat ttt ggc aat gac tat gag gac cgt tac tat cgt gaa aac atg cac cgt tac ccc aac caa gtg tac tac agg cca gtg gat cag tat agt aac cag aac aac ttt gtg cat gac tgt gtc aac atc aca gtc aag gaa cac aca gtc acc acc acc acc aag ggg gag aac ttc acc gaa act gac atc aag atg atg gag cga gtg gtg gag caa atg tgc atc acc cag tac cag aga gaa tcc cag gct tat tac caa cga ggg gca agt - - gtg atc ctc ttc tct tcc cct cct gtg atc ctc - - - - - - - - - - - - 54 cow Bos taurus D10614 short D90547 771bp wt main dna >125_Bos.tau.sho.fer.rum.bov:: atg gtg aaa agc cac ata ggc agt tgg atc ctg gtt ctc ttt gtg gcc atg tgg agt gac gtg ggc ctc tgc aag aag cga cca aaa cct ggc gga gga tgg aac act ggg ggg agc cga tac ccg gga cag ggc agt cct gga ggc aac cgc tat cca ggt ggt - agc cac agt cag tgg aac aaa ccc agt aag cca aaa acc aac atg aag cat gtg gca gga gct gct gca gct gga gca gtg gta ggg ggc ctt ggt ggc tac atg ctg gga agt gcc atg agc agg cct ctt ata cat ttt ggc aat gac tat gag gac cgt tac tat cgt gaa aac atg cac cgt tac ccc aac caa gtg tac tac agg cca gtg gat cag tat agt aac cag aac aac ttt gtg cat gac tgt gtc aac atc aca gtc aag gaa cac aca gtc acc acc acc acc aag ggg gag aac ttc acc gaa act gac atc aag atg atg gag cga gtg gtg gag caa atg tgc att acc cag tac cag aga gaa tcc cag gct tat tac caa cga ggg gca agt - - gtg atc ctc ttc tct tcc cct cct gtg atc ctc ctc atc tct ttc ctc att ttt ctc ata gta gga tag 55 cow Bos taurus S55629 long 6 repeats all:long main dna >130_Bos.tau.lon.fer.rum.bov:: atg gtg aaa agc cac ata ggc agt tgg atc ctg gtt ctc ttt gtg gcc atg tgg agt gac gtg ggc ctc tgc aag aag cga cca aaa cct gga gga gga tgg aac act ggg ggg agc cga tac cca gga cag ggc agt cct gga ggc aac cgt tat cca ggt ggt - acc cac ggt caa tgg aac aaa ccc agt aag cca aaa acc aac atg aag cat gtg gca gga gct gct gca gct gga gca gtg gta ggg ggc ctt ggt ggc tac atg ctg gga agt gcc atg agc agg cct ctt ata cat ttt ggc agt gac tat gag gac cgt tac tat cgt gaa aac atg cac cgt tac ccc aac caa gtg tac tac agg cca gtg gat cag tat agt aac cag aac aac ttt gtg cat gac tgt gtc aac atc aca gtc aag gaa cac aca gtc acc acc acc acc aag ggg gag aac ttc acc gaa act gac atc aag atg atg gag cga gtg gtg gag caa atg tgc att acc cag tac cag aga gaa tcc cag gct tat tac caa cga ggg gca agt - - gtg atc ctc ttc tct tcc cct cct gtg atc ctc ctc atc tct ttc ctc att ttt ctc ata gta gga tag 58 cow Bos taurus AB001468 long 6 repeats all:long main dna >145_Bos.tau.lon.fer.rum.bov:: atg gtg aaa agc cac ata ggc agt tgg atc ctg gtt ctc ttt gtg gcc atg tgg agt gac gtg ggc ctc tgc aag aag cga cca aaa cct gga gga gga tgg aac act ggg ggg agc cga tac cca gga cag ggc agt cct gga ggc aac cgt tat cca ggt ggt - acc cac ggt caa tgg aac aaa ccc agt aag cca aaa acc aac atg aag cat gtg gca gga gct gct gca gct gga gca gtg gta ggg ggc ctt ggt ggc tac atg ctg gga agt gcc atg agc agg cct ctt ata cat ttt ggc agt gac tat gag gac cgt tac tat cgt gaa aac atg cac cgt tac ccc aac caa gtg tac tac agg cca gtg gat cag tat agt aac cag aac aac ttt gtg cat gac tgt gtc aat atc aca gtc aag gaa cac aca gtc acc acc acc acc aag ggg gag aac ttc acc gaa act gac atc aag atg atg aag cga gtg gtg gag caa atg tgc att acc cag tac cag aga gaa tcc cag gct tat tac caa cga ggg gca agt - - gtg atc ctc ttc tct tcc cct cct gtg atc ctc ctc atc tct ttc ctc att ttt ctc ata gta gga tag 119 cow Bos taurus AJ132392 long 7 repeats all:long 7 main dna >147_Bos.tau.lon.fer.rum.bov:: - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - gga gga tgg aac act ggg ggg agc cga tac cca gga cag ggc agt cct gga ggc aac cgt tat cca ggt - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 87 nyala Tragelaphus angasi unpub.Sch24 - wt main dna >155_Tra.ang.....fer.rum.bov:: - - - - - - - - - - - - - - - - atg tgg agt gat gtg ggc ctc tgc aag aag cga cca aaa cct gga gga gga tgg aac act ggg ggg agc cga tac cca gga cag ggc agt cct gga ggc aac cgc tat cca ggt ggt - acc cac ggt cag tgg aac aag ccc agt aag cca aaa acc aac atg aag cat gtg gca gga gct gct gca gca gga gca gtg gta ggg ggc ctt ggt ggc tac atg ctg gga agt gcc atg agc agg cct ctt aca cat ttt ggc aat gac tat gag gac cat tac tat cgt gaa aac atg tac cgt tac ccc aac caa gtg tac tac agg cca gtg gat cag tat agt aac cag aac aac ttt gtg cat gac tgt gtc aac atc aca gtc aag cag cac aca gtc acc acc acc acc aag ggg gag aac ttc acc gaa act gac atc aaa atg atg gag cga gtg gtg gag caa atg tgc atc acc cag tac cgg aga gaa tcc cag gct tat tac caa aga gga gca agt - - gtg atc ctc ttc tct tcc cct cct gtg - - - - - - - - - - - - - - 60 greater kudu Tragelaphus strepsiceros X74759 C extra P40243 X74759 X74771 bad Martin TC all:long main dna >160_Tra.str.lon.fer.rum.bov:: atg gtg aaa agc cac ata ggc agt tgg atc ctg gtc ctc ttt gtg gcc atg tgg agt gac gtg gcc ctc tgc aag aag cga cca aaa cct gga gga gga tgg aac act ggg ggg agc cga tac ccg gga cag ggc agt cct gga ggc aac cgc tat cca ggt ggt - acc cac ggt cag tgg aac aag ccc agt aag cca aaa acc aac atg aaa cat gtg gca gga gct gct gca gcg gga gca gtg gta ggg ggc ctt ggt ggc tac atg ctg gga agt gcc atg agc agg cct ctt ata cat ttt ggc agt gac tat gag gac cgt tac tat cgt gaa aac atg tac cgt tac ccc aac caa gtg tac tac agg cca gtg gat cag tat agt aac cag aac aac ttt gtg cat gac tgt gtc aac atc aca gtc aag cag cac aca gtc acc acc acc acc aag ggg gag aac ttc acc gaa act gac atc aag atg atg gag cga gtg gtg gag caa atg tgc atc acc cag tac cag aga gaa tcc gag gct tat tac caa cga ggg gca agt - - gtc atc ctc ttc tct tcc cct cct gtg atc ctc ctc atc tct ttc ctc att ttt ctc ata gta gga tag 111 greater kudu Tragelaphus strepsiceros unsub.Poi B Poidinger M Arch Virol 131: 193-199 (1993) wt main dna >161_Tra.str.sho.fer.rum.bov:: atg gtg aaa agc cac ata ggc agt tgg atc ctg gtt ctc ttt gtg gcc atg tgg agt gac gtg ggc ctc tgc aag aag cga cca aaa cct ggt gga gga tgg aac act ggg gga agc cga tac ccg gga cag ggc agt cct gga ggc aac cgc tat cca ggt ggt - acc cac agt cag tgg aac aag ccc agt aag cca aaa acc aac atg aag cat gtg gca gga gct gct gca gct gga gca gtg gta ggg ggc ctt gga ggc tac atg ctg gga agc gcc atg agc agg cct ctt ata cat ttt ggc aat gac tat gag gac cgt tac tac cgt gaa aac atg tac cgt tac ccc aac caa gtg tac tac aga cca gtg gat cag tat agt aac cag aac aac ttt gtg cat gac tgt gtc aac atc aca gtc aag caa cac aca gtc acc acc acc acc aag ggg gag aac ttc acc gaa act gac atc aag atc atg gag cga gtg gtg gag caa atg tgc atc acc cag tac cag aga gaa tcc cag gct tat tac caa aga ggg gca agt - - gtg atc ctc ttc tct tcc cct cct gtg atc ctc ctc atc tct ttc ctc att ttt ctc ata gta gga tag 50 african goat Capris hircus S82626 - wt main dna >167_Cap.hir.....fer.rum.ovi:: atg gtg aaa agc cac ata ggc agt tgg atc ctg gtt ctc ttt gtg gcc atg tgg agt gac gtg ggc ctc tgc aag aag cga cca aaa cct ggc gga gga tgg aac act ggg ggg agc cga tac ccg gga cag ggc agt cct gga ggc aac cgc tat cca ggt ggt - agc cac agt cag tgg aac aag ccc agt aag cca aaa acc aac atg aag cat gtg gca gga gct gct gca gct gga gca gtg gta ggg ggc ctt ggt ggc tac atg ctg gga agt gcc atg agt agg cct ctt ata cat ttt ggc aat gac tat gag gac cgt tac tat cgt gaa aac atg tac cgt tac ccc aac caa gtg tac tac aga cca gtg gat cag tat agt aac cag aac aac ttt gtg cat gac tgt gtc aac atc aca gtc aag caa cac aca gtc acc acc acc acc aag ggg gag aac ttc acc gaa act gac atc aag ata atg gag cga gtg gtg gag caa atg tgc atc acc cag tac cag aga gaa tcc cag gct tat tac caa agg ggg gca agt - - gtg atc ctc ttt tct ccc cct cct gtg atc ctc ctc atc tct ttc ctc att ttt ctc ata gta gga tag 53 goat Capris hircus unpub.Sch11 - all:212 RQ main dna >180_Cap.hir.....fer.rum.ovi:: atg gtg aaa agc cac ata ggc agt tgg atc ctg gtt ctc ttt gtg gcc atg tgg agt gac gtg ggc ctc tgc aag aag cga cca aaa cct ggc gga gga tgg aac act ggg ggg agc cga tac cca gga cag ggc agt cct gga ggc aac cgc tat cca ggt ggt - agc cac agt cag tgg aac aag ccc agt aag cca aaa acc aac atg aag cat gtg gca gga gct gct gca gct gga gca gtg gta ggg ggc ctt ggt ggc tac atg ctg gga agt gcc atg agc agg cct ctt ata cat ttt ggc aat gac tat gag gac cgt tac tat cgt gaa aac atg tac cgt tac ccc aac caa gtg tac tac aga cca gtg gat cag tat agt aac cag aac aac ttt gtg cat gac tgt gtc aac atc aca gtc aag caa cac aca gtc acc acc acc acc aag ggg gag aac ttc acc gaa act gac atc aag ata atg gag caa gtg gtg gag caa atg tgc atc acc cag tac cag aga gaa tcc cag gct tat tac caa agg ggg gca agt - - gtg atc ctc ttt tct tcc cct cct gtg atc ctc ctc atc tct ttc ctc att ttt ctc ata gta gga - 105 nubian ibex Capra ibex nubiana unpub.Sch02 - wt main dna >185_Cap.ibe.....fer.rum.ovi:: - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - aaa cct ggc gga gga tgg aac act ggg ggg agc cga tac ccg gga cag ggc agt cct gga ggc aac cgc tat cca ggt ggt - agc cac agt cag tgg aac aag ccc agt aag cca aaa acc aac atg aag cat gtg gca gga gct gct gca gct gga gca gtg gta ggg ggc ctt ggt ggc tac atg ctg gga agt gcc atg agt agg cct ctt ata cat ttt ggc aat gac tat gag gac cgt tac tat cgt gaa aac atg tac cgt tac ccc aac caa gtg tac tac aga cca gtg gat cag tat agt aac cag aac aac ttt gtg cat gac tgt gtc aac atc aca gtc aag caa cac aca gtc acc acc acc acc aag ggg gag aac ttc acc gaa act gac atc aag ata atg gag cga gtg gtg gag caa atg tgc atc acc cag tac cag aga gaa tcc cag gct tat tac ca. - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 108 muskox Ovibos moschatus moschatus unpub.Sch06 - wt main dna >190_Ovi.mos.....fer.rum.ovi:: atg gtg aaa agc cac ata ggc agt tgg atc ctg gtt ctc ttt gtg gcc atg tgg agt gac gtg ggc ctc tgc aag aag cga cca aaa cct ggc gga gga tgg aac act ggg ggg agc cga tac ccg gga cag ggc agt cct gga ggc aac cgc tat cca ggt ggt - 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